5章-蛋白质的三维结构-教学用.pptVIP

原胶原纤维分子稳定的共价键原胶原纤维分子内交联：N末端区内Lys残基之间进行分子间交联：N末端区和C末端区两个5-羟-Lys随着年龄增长，交联越来越多，使腱、骨骼变脆，关节不灵活胶原蛋白使骨、腱、软骨和皮肤具有机械强度。腱胶原纤维有很高的抗张强度，约为20-30kg/mm2，相当于12号冷拉钢丝的拉力。骨骼中胶原纤维周围排列着羟基磷灰石(Ca10(PO4)6(OH)2)结晶。脊椎动物的皮肤含有编织比较疏松，向各个方向伸展的胶原纤维。血管亦含胶原纤维。基底膜蛋白聚糖层黏连蛋白巢蛋白Pro和Lys的羟基化学习内容一、研究蛋白质构象的方法

二、稳定蛋白质三维结构的力

三、多肽主链折叠的空间限制四、二级结构：多肽主链的局部规则构象五、纤维状蛋白质

六、超二级结构和结构域七、球状蛋白质与三级结构八、亚基缔合与四级结构九、蛋白质的变性与折叠六、超二级结构和结构域(一)超二级结构(二)结构域(一)超二级结构1973，RossmanM.G.提出，也称基元（motif）。超二级结构（折叠单位或折叠花式，foldingmotif）:蛋白质中，特别是球蛋白中，经常看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起，彼此相互作用，形成的有规则、在空间上能辨认的二级结构组合体，在多种蛋白质中充当三级结构的部件，称为超二级结构。三种基本形式：αα、βαβ、ββ（二）结构域结构域的概念：结构域通常都是几个超二级结构单元的组合。或者说是在二级结构或超二级结构的基础上形成的三级结构的局部折叠，它是相对独立的紧密球状实体，独立的折叠单位。氨基酸残基：100～200氨基酸残基，少至40，多至400。对于较小的蛋白质或亚基而言，结构域和三级结构有同含义，是单结构域的，如红氧还蛋白、核糖核酸酶、肌红蛋白等；对于较大的蛋白质或亚基来说，其三级结构往往由两个或多个结构域结合而成，是多结构域的，如免疫球蛋白（2）、t－PA（6）。结构域有时也指功能域，功能域是蛋白质分子中能独立存在的功能单位。功能域可是一个结构域，也可是两个或两个以上的结构域组成，如酵母己糖激酶。功能域之间有一段柔性的铰链区，使之能滑动，发挥作用。从结构角度看，一条多肽链先分成几个相对独立的结构域，再缔合成三级结构，在动力学上更为合理；从功能角度看，多结构域的酶，其活性中心位于结构域之间。（二）结构域裂沟活性中心处于两个功能域交界处结构域举例：学习内容一、研究蛋白质构象的方法

二、稳定蛋白质三维结构的力

三、多肽主链折叠的空间限制四、二级结构：多肽主链的局部规则构象五、纤维状蛋白质

六、超二级结构和结构域七、球状蛋白质与三级结构八、亚基缔合与四级结构九、蛋白质的变性与折叠七、球状蛋白质与三级结构球状蛋白质特点：含几种类型的二级结构，折叠成球状实体；能溶于水，发挥动态功能；三级结构花式多样，这是功能基础。(一)球状蛋白质及其亚基的分类(二)球状蛋白质三维结构的特征全α结构（反平行α螺旋结构）；α,β结构（平行或混合型β折叠片结构域）；全β结构（反平行β折叠片结构域）；富含金属或二硫键结构域（不规则小蛋白结构）（一）球状蛋白质及其亚基的分类结构域大体上可以分为四种类型：蚯蚓肌红蛋白子宫球蛋白TMV外壳蛋白红血球凝聚素1.全α结构（反平行α螺旋）α螺旋占极大优势，分成几个亚类,反平行α螺旋其中最大一类，最常见的是四螺旋束另一亚类：珠蛋白型α螺旋蛋白，包括去血红素的肌红蛋白和血红蛋白的α和β亚基单绕平行β桶或称为平行β桶。另一类为双绕平行β片或称为马鞍形扭曲片。2.α,β结构（平行β片）以平行β折叠片为基础。α，β-结构分两个亚类：单绕平行β桶或称为平行β桶双绕平行β片或称为马鞍形扭曲片Anotherparallel-structureconsistsofaninternaltwistedwallofparallelormixed-sheetprotectedonbothsidesbyhelicesorothersubstructures.Thisstructureiscalledthedoublywoundparallel-sheet.3.全β结构(反平行β片)大豆胰蛋白酶抑制剂红氧还蛋白木瓜蛋白酶结构域2伴刀豆凝集素γ-晶体蛋白链霉属枯草杆菌蛋白酶抑制剂谷胱甘肽还