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生物信息学

;生物信息学;生命信息系统;相关学科图示;广义概念图示;狭义概念图示;总结：生物信息学;生物学根底速递;生命的分子根底;DNA结构和碱基互补原理;中心法那么;生物信息学的历史;曼哈顿原子弹方案;60年代初，美国总统Kennedy提出两个科学方案：

?登月方案

?攻克肿瘤方案?人类遗传信息的复杂性;生命活动三要素：物质、能量、信息;基因组(Genome)：包含细胞或生物体全套的遗传信息的全部

遗传物质。原核生物(细菌、病毒等)

真核生物(真菌、植物、动物等);HGP的历史回忆;第一个自由生物体流感嗜血菌(H.inf)的全基因组测序完成

1996完成人类基因组方案的遗传作图

启动模式生物基因组方案;1997大肠杆菌(E.coli)全基因组测序完成

1998完成人类基因组方案的物理作图

开始人类基因组的大规模测序

Celera公司参加，与公共领域竞争

启动水稻基因组方案

1999.7第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度;1999.7第5届国际公共领域人类基因组测序会议，加快测序速度

2000Celera公司宣布完成果蝇基因组测序

国际公共领域宣布完成第一个植物基因组——拟南芥全基

因组的测序工作;2001年2月15日《Nature》封面;我国对人类基因组方案的奉献;HGP带来的科学挑战;各学科参与、协作：生命科学、数学、物理学、化学、计算机

科学、材料科学以及伦理、法律等社会科学……

?首要科学问题

如何找到记载在基因组DNA一维结构上控制生命时间、空间

的调控信息的编码方式和调节规律。

应用数学、复杂系统理论、信息论、非线性科学……

催生?生物信息学、计算生物学

?芯片技术

交叉性技术领域：物理学、微电子信息技术、生化技术、信

息技术、自动化、材料科学……

?结构生物学

前沿领域之一：生物物理学、生物化学、晶体学、波谱学、

光谱学以及X射线晶体衍射技术、核磁共振技术……

;生物信息学的开展历史;

20世纪50年代，生物信息学开始孕育

20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算

生物学和计算机科学联系起来

20世纪70年代，生物信息学的真正开端

20世纪70年代到80年代初期，出现了一系列著

名的序列比较方法和生物信息分析方法

20世纪80年代以后，出现一批生物信息效劳机

构和生物信息数据库

20世纪90年代后，HGP促进生物信息学的迅速

开展;关于生物信息学开展历程中的重要大事，

请参见下面两个网站的介绍：

/BLASTinfo/milestones.html、

:///bioinformatics/。;生物信息学的研究内容;基因组

数据库;数据库搜索及序列比较;基因组序列分析;基因表达数据的分析与处理;蛋白质结构预测;二级结构预测;空间结构预测;生物信息学当前的主要任务;基因组;非蛋白编码区生物学意义的分析;非蛋白编码区约占人类基因组的95%，其生物学意义目前尚不是很清楚，但从演化观点来看，其中必然蕴含着重要的生物学功能，由于它们并不编码蛋白，一般认为，它们的生物学功能可能表达在对基因表达的时空调控上。

对非蛋白编码区进行生物学意义分析的策略有两种，一种是基于已有的已经为实验证实的所有功能的DNA元件的序列特征，预测非蛋白编码区中可能含有的功能的DNA元件，从而预测其可能的生物学功能，并通过实验进行验证；另一种那么是通过数理理论直接探索非蛋白编码区的新的未知的序列特征，并从理论上预测其可能的信息含义，最后同样通过实验验证。;基因组整体功能及其调节网络的系统把握;基因组演化与物种演化(生命之树);尽管已经在分子演化方面取得了许多重要的成就，但仅仅依靠某些基因或者分子的演化现象，就想说明物种整体的演化历史似乎不太可靠。例如，智人与黑猩猩之间有98%-99%的结构基因和蛋白质是相同的，然而表型上却具有如此巨大的差异，这就不能不使我们联想到形形色色千差万别的建筑楼群，它们的外观如此不同，但根底的部件组成却是几乎一样的，差异就在于这些根底部件的组织方式不同，这就提示我们基因组整体组织方式而不仅仅是个别基因在研究物种演化历史中的重要作用。由于基因组是物种所有遗传信息的储藏库，从根本上决定着物种个体的发育和生理，因此