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噪声性听觉损伤易感豚鼠的差异表达基因筛选研究的开题报告
1.研究背景
噪声是一种常见的环境污染因素,长期暴露于高强度噪声环境中会导致听觉损伤。豚鼠是一种常用的实验动物,其在噪声性听觉损伤研究中具有较高的应用价值。然而,豚鼠对噪声的耐受性差异较大,存在易感个体。为了探究易感豚鼠与耐受豚鼠在基因水平上的差异,本研究将进行基因筛选分析。
2.研究目的
本研究旨在通过RNA测序技术分析易感豚鼠与耐受豚鼠在噪声性听觉损伤过程中差异表达的基因,鉴定变异基因并进行功能注释和通路分析,为揭示噪声性听觉损伤的分子机制提供参考。
3.研究方法
(1)动物模型制备:将青年雄性SD大鼠随机分为两组,一组进行50dB音压下1小时的噪声暴露,另一组作为对照组。
(2)样品采集:在暴露后24小时内,随机选择10只易感豚鼠和10只耐受豚鼠,分别进行内听毛细胞的分离和提取RNA样本。
(3)RNA测序:利用IlluminaHiSeqXTen平台进行RNA测序,获取每只样本约30GB的测序数据。
(4)数据处理:使用Trimmomatic和HISAT2对测序数据进行质控、过滤、比对和组装。使用DESeq2和edgeR软件对基因表达水平进行差异分析和GO和KEGG富集分析。
4.预期结果
本研究预计将筛选出噪声性听觉损伤易感豚鼠与耐受豚鼠之间的差异表达基因,并进一步分析这些基因的功能和通路注释。预计将发现与噪声性听觉损伤相关的基因和通路,从而揭示噪声性听觉损伤的分子机制。
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