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合成生物学

简介;内容;合成生物学(syntheticbiology)

基于系统生物学的遗传工程和工程方法的人工生物系统研究，从基因片段、DNA分子、基因调控网络与信号传导路径到细胞的人工设计与合成，类似于现代集成型建筑工程，将工程学原理与方法应用于遗传工程与细胞工程等生物技术领域，合成生物学、计算生物学与化学生物学一同构成系统生物技术的方法基础。

;;标准化

抽象化

复杂系统去偶合;标准化;2003MIT成立了标准生物部件登记处，数据库收集了3200个标准化生物学部件。

;StandardAssembly;;将一个复杂的问题分解成若干可操作的独立的简单问题。;标准生物部件

具有特定生物学功能的基因编码元件

启动子、调控因子、核糖体结合位点、编码序列、终止子

;将这些器件逐级设计构建组合成具有特定功能的生物系统。

;合成生物学的研究方向;1）基因拨动开关e.g.E.coli

;;2）基因振荡器;;代谢途径改造----调节核心组件优化途径;1.生物质能和乙醇发酵微生物;可用于发酵生产乙醇的部分微生物及其主要底物;酵母的乙醇代谢工程;酵母的木糖代谢工程;大肠杆菌的乙醇代谢工程;主要优势

大肠杆菌能够利用非常广泛的碳源，其中包括六碳糖(葡萄糖，果糖)和五碳糖(木糖，阿拉伯糖)以及糖酸等物质，这一特性使得大肠杆菌能利用木质纤维素降解产生的各种糖类，同时又由于大肠杆菌遗传背景清楚，因此在原核微生物乙醇代谢工程以及木质纤维素的高效利用中具有重要的研究价值。;大肠杆菌乙醇代谢工程中存在的问题;2.青蒿酸合成线路的设计构建;由于在生物合成抗疟疾药物的突出成就,Keasling被美国“发现”杂志评选为2006年度最有影响的科学家。

该项目已经获得比尔-梅林达盖茨基金会4300万美元的资助,进行进一步的实验室研究、中试、临床实验等后续工作。

;3.代谢途径的快速进化

基因突变

改造代谢途径

生产目标化合物;;4.利用合成生物学生产新能源

Kaslling利用13个可逆的酶促反应组合起来创建一条非天然的催化路径。

淀粉+水H2

;;;;1.人工构建合成生命体

;三个步骤：合成、组装和移植;组装：

因为合成生物学技术上的局限，不能直接合成上万碱基对的DNA大分子，所以Venter等人巧妙地借助啤酒酵母和大肠杆菌的帮助，把1Kb的DNA分子有序准确的连成超过1000kb的片段。

移植：

Venter等把这个合成基因组移植到不含限制性酶切系统的山羊支原体中，基因组能使用后者的酶系统进行自我复制，经过多代繁殖后，长成的菌落已经纯粹由蕈状支原体组成。;《用化学合成的基因组构建一个细菌细胞》;2.最小基因组的构建

Blattnerj小组删除大肠杆菌基因组的15%（高达82Kb）,细菌仍保持了良好的生存状态。

改造后菌株的电穿孔效率、基因表达都有改变。

;;;15.3.4构建多细胞体系

多细胞体系是建立在群体细胞效应的研究基础上，多细胞涉及细胞间的通信体系。

群体效应：微生物通过自身产生的一种化学信号来感受群体的浓度，从而表现出某种特殊的行为。;;枯草芽胞杆菌利用QS系统对细胞的发育进行调控

当营养丰富、菌体稀少时向感受态方向发展；

营养贫乏菌体密度高时向芽胞方向发展。;15.4展望

2004年合成生物学被美国MIT出版的《技术评论》评为“将改变世界的10大新技术之一”。

美国生物经济研究协会2007年发表了题为《基因组合成和设计未来：对美国经济的影响》的研究报告。;细菌能估计刺激物的距离，并根据距离的改变做出反应。

该项研究可用来探测地雷位置：

靠近地雷时细菌发绿光；

远离地雷时则发红光。;ThankYou!;感谢阅读