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基于随机微分方程和结构EM算法的系统发生树的构建的任务书
任务简述：
在系统发生树的构建中，随机微分方程（SDE）模型是一种常见的方法，它可以帮助研究人员描述系统的演化过程。但是，由于数据的限制和模型的复杂性，SDE模型的参数估计和树的构建仍然是一个挑战性的问题。因此，基于SDE模型和结构EM算法的方法可以帮助解决这个问题。
本任务的主要目标是基于SDE模型和结构EM算法，构建系统发生树，并对模型进行参数估计和树的拟合程度评估。
任务要求：
1.掌握随机微分方程（SDE）和结构EM算法的基本理论和方法。
2.通过阅读相关文献和资料，了解系统发生树的构建方法和应用。
3.根据所学知识，设计和实现一个基于SDE模型和结构EM算法的系统发生树构建程序。
4.利用现有数据，对构建的系统发生树进行评估和验证，分析模型的拟合程度和发现可能的系统演化事件。
5.撰写实验报告，详细描述模型构建和实验过程，及结果分析和讨论。
参考文献：
1.Rodrigo,A.G.,Hernández-Rosales,M.,García-Martínez,J.,Mu?oz,A.G.(2019).Inferringeffectivepopulationsizes,coalescenttimes,andtreetopologiesinstructuredpopulationsusingaslidingwindowapproach.PLoScomputationalbiology,15(1),e1006782.
2.Murrell,B.,Weaver,S.,Smith,M.D.,Wertheim,J.O.,Murrell,S.,Aylward,A.,...Scheffler,K.(2015).Gene-wideidentificationofepisodicselection.Molecularbiologyandevolution,32(5),1365-1371.
3.Steinrücken,M.,Wu,M.(2017).Fastmanifoldlearningforstochasticdifferentialequations.JournalofComputationalPhysics,330,14-45.
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