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研究生学位论文开题报告

报告题目紫花针茅ERF1、ERFL1a、ERF4及CRF4基因

的功能研究

学生姓名学号

指导教师职称

学位类别理学硕士

学科专业植物学

研究方向

研究所（院系）

填表日期

中国科学院大学制

填表说明

本表内容须真实、完整、准确。

“学位类别”名称：学术型学位填写哲学博士、教育学博士、理学博士、工学博士、农学博士、医学博士、管理学博士，哲学硕士、经济学硕士、法学硕士、教育学硕士、文学硕士、理学硕士、工学硕士、农学硕士、医学硕士、管理学硕士等；专业学位填写工程博士、工程硕士、工商管理硕士（MBA）、应用统计硕士、翻译硕士、应用心理硕士、农业推广硕士、工程管理硕士、药学硕士等。

“学科专业”名称：学术型学位填写“二级学科”全称；专业学位填写“培养领域”全称。

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报告提纲

选题的背景及意义

国内外本学科领域的发展现状与趋势

2.1乙烯响应因子（ethyleneresponsefactor、ERF）家族的结构特点及序列信息

ERF基因家族是一个很大的转录因子家族，属于AP2/ERF转录因子超家族。Ohme-Takagi和Shinshi研究发现，GCCbox是植物乙烯响应的DNA序列元件；同时他们在烟草（Nicotianatabacuum）中发现了能特异性结合GCCbox元件的数个乙烯响应元件结合蛋白（EREBPs），并发现，EREBPs同GCC元件相结合的结构域是59个保守的氨基酸残基。AP2/ERF转录因子超家族的共同特征是都具有保守的AP2/ERF结构域。根据AP2/ERF结构域的个数以及是否含有其他的结构域，将AP2/ERF转录因子超家族分为三个家族：AP2家族，含有两个重复的AP2/ERF结构域；ERF家族，只含有一个AP2/ERF结构域；RAV家族，除了含有一个AP2/ERF结构域以外，还有另外的一个B3结构域。另外，根据AP2/ERF结构域保守氨基酸的不同，又将ERF转录因子家族分为ERF亚家族和CBF/DREB亚家族。Sakuma等根据DNA结合结构域的序列相似性将CBF/DREB亚家族分为6个group：A-1~A-6，将ERF亚家族分为6个group：B-1~B-6。

ERF结构域的三级结构ERF转录因子能够识别两种DNA序列顺式作用元件，即GCCbox和CRT/DRE元件。GCCbox的保守序列为AGCCGCC。ERF转录因子的N端的59个氨基酸残基是识别GCCbox所必须的。Allen等研究了ERF结构域的3D结构，发现ERF结构域中有一个三条链的反向平行的β折叠和一个α螺旋，通过β折叠与DNA顺式元件相结合。Hao等发现，GCCbox的第一个G、第四个G和第六个C是ERF结构域识别所必须的；同时，N端的侧翼序列是ERF结构域结合GCCbox所必须的。CRT/DRE元件的保守序列为A/GCCGAC，在DREB蛋白的AP2/ERF结构域中，β折叠中的第14位缬氨酸和19位谷氨酸是结合顺式元件所必需的；而在ERF蛋白中，丙氨酸和天冬氨酸占据了同样的位置。这两个氨基酸位于AP2/ERF结构域中的β折叠上。此外，一些ERF基因如NtERF3，AtERF3，和AtERF4属于groupVIII类的ERF基因，具有转录抑制活性。Ohta等研究发现，在这些转录抑制因子C端有一个保守的(L/F)DLN(L/F)xP结构域，称为ERF相关的两亲性抑制结构域（ERF-associatedamphiphilicrepressionmotif，EARmotif）。

ERF结构域的三级结构

Nakano等在拟南芥基因组中共发现了147个基因属于AP2/ERF超家族，其中有122个基因属于ERF基因家族。对ERF家族的122个成员进行AP2/ERF结构域的氨基酸序列的多重比对分析发现，GLY-4、Arg-6、Glu-16、Trp-28、Leu-29、Gly-30和Ala-38完全保守，而Arg-8、Gly-11、Ile-17、Arg-18、Arg-26、Ala-39、Asp-43和Asn-57存在于超