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线性泛素链探针的制备与初步应用
泛素化修饰是常见的蛋白质翻译后修饰类型,是单泛素或泛素链分子在泛素激
活酶E1、泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的连续催化下连接到靶蛋白上的过程。
而去泛素化则是由去泛素化酶(DUB)催化将这些修饰分子从靶蛋白上水解掉的
逆反应过程。泛素是由76个氨基酸组成的分子量为8.5kDa的小蛋白质,其7个赖
氨酸位点与N端的甲硫氨酸位点均可被泛素化修饰,进而形成不同类型的泛素链分
子。一个泛素分子N端甲硫氨酸的α氨基与另一个泛素分子C端第76位甘氨酸的
α羧基连接形成的是线性泛素链,也称为M1型泛素链。本实验室前期的研究发现
线性泛素链对靶蛋白具有整链修饰的功能,为揭示参与此修饰过程的相关酶,也为
阐明相关修饰机制的研究提供实用的研究工具,本研究应用本实验室发明的新策略,
制备了线性泛素链蛋白与探针,并应用细胞内外反应进行了功能分析与实用性验证。
首先,本研究在大肠杆菌中成功表达纯化了所构建的线性泛素链探针蛋白,然
后利用Intein化学合成技术,成功制备出线性泛素链探针。所制备的探针使用Strep
TagII作为报告标签,用于分离和提取被探针捕获的酶;识别元件使用75位突变型
(G75A)、76位突变型(G76A)和野生型(WT)三种类型线性泛素链,用于介
导探针与酶的非共价互作;反应基团(也称靶向弹头)使用的是溴乙胺(Br)和
2
炔丙胺(Prg),用于探针与酶活性中心的半胱氨酸形成共价键,从而实现相关酶
的捕获与分离。同时,本研究还在HEK293T、HepG2和Hela细胞内外分析了这些
线性泛素链蛋白的修饰功能与稳定性,并应用这些细胞的裂解物验证了所制备的重
组线性泛素链探针捕获分离泛素化相关酶的实用性。
结果表明,所制备的三种类型的线性泛素链均可在细胞内发挥修饰功能,相比
WT型链,G75A型链最不稳定,而G76A型链最稳定,可以修饰更多的靶向蛋白,
此结果说明G75A突变破坏了泛素链的稳定性,而G76A突变则增强了泛素链的稳
定性,此结果还暗示,这些泛素化修饰反应过程可能还同时伴随着去泛素化的反应
过程。细胞外的互作结果显示,WT型链探针不与去泛素化酶OTULIN结合,但可
被OTULIN水解,说明所制备的WT型泛素链为天然连接,在含有特异水解酶条件
下不稳定;G75A型链探针不与OTULIN结合,更易被水解;G76A型链探针不被
I
OTULIN水解,但也不与OTULIN结合,结合细胞内结果,进一步证明G75A突变
影响了泛素链的稳定性,而G76A突变则增强了泛素链的稳定性,同时说明
OTULIN属于内切酶类,泛素分子的G75和G76两保守位点对单泛素分子和泛素链
的稳定性以及OTULIN的水解活性至关重要。功能性研究发现,三种类型的线性泛
素链探针均可靶向捕获去泛素化酶UCH-L3形成共价加合物(adduct),但不与去
泛素化酶USP15互作,证明本研究制备的探针具有靶向特异性。应用HEK293T、
Hela和HepG2三种细胞系进行探针捕获酶的研究,结果发现,双泛素及四泛素长
度的WT型线性泛素链探针均可从三种细胞裂解物中捕获包括E1、E2、E3和DUB
四种酶在内的各种细胞内蛋白,但未发现两种突变型链探针与酶形成的加合物,说
明天然反应条件下,泛素C末端的两个非手性Gly位点的突变可能影响了线性泛素
链的空间结构及其非手性构象变化的灵活性,进而破坏了探针与靶酶的识别与互作。
本研究还利用LC-MS/MS
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