2023高通量测序技术在分枝杆菌病诊断中的应用专家共识完整版.pdfVIP

2023高通量测序技术在分枝杆菌病诊断中的应用专家共识(完整版)

摘要

高通量测序技术在分枝杆菌病领域中的应用日益普及，而在实际应用过程中，临床

医师对技术本身及如何合理应用检测结果仍存在很多疑问。本共识针对高通量测

序技术临床应用中存在的突出问题，依据公开发表的研究数据和参与专家的应用

经验，经众多专家讨论形成，为在分枝杆菌病诊断过程中合理使用高通量测序技术

提供参考。

high-throughputsequencing)

高通量测序(技术在感染性疾病病原学诊断及常见

病原微生物的耐药诊断中优势明显，在分枝杆菌病领域也得到越来越广泛的应用，

为疑难分枝杆菌病的诊断、鉴别诊断和耐药诊断提供了循证医学证据。

然而在实际应用过程中，临床医师存在诸多困惑。鉴于此，高通量测序共识专家组

针对高通量测序技术临床使用过程中存在的突出问题，撰写了本共识，以期提高该

技术的临床应用水平，去伪存真，使这项先进的检验技术得到科学合理的应用。

一、高通量测序技术概况

高通量测序技术泛指二代测序技术和第三代测序技术，目前已有多种用于临床感

染性疾病的病原微生物鉴定，尤其是当缺乏诊断线索时，鉴定病原微生物具有显著

（

优势。依据检测策略的不同，其主要分为靶向测序、宏基因组学测序mNGS）

和全基因组测序（

分枝杆菌靶向测序技术是先通过靶向捕获分枝杆菌特异基因后再进行高通量测序，

主要适用于临床怀疑分枝杆菌感染的患者，既有助于诊断结核病/非结核分枝杆菌

（

NTM）病，又可以检测耐药基因突变,从而精准指导临床医师用药。

2018年，WHO发布的《应用高通量测序技术检测耐药结核病相关基因突变的技

术指导原则》重点关注了靶向测序技术用于结核病耐药诊断的功能。mNGS技术

则是直接对标本中所有的核酸进行无偏倚检测和序列分析，相比分枝杆菌靶向测

序，mNGS可检测出种类繁多的微生物，但无法实现对结核分枝杆菌耐药基因的

全面检测。

二、高通量测序技术的特点

二代测序技术近年来发展迅猛，具有通量高、速度快的优点，但存在读长较短，不

利于后续生物信息学分析的缺点，且PCR扩增过程中DNA序列碱基的G-C偏

好性会影响检测的准确性。

，DNA/RNA

第三代测序技术也被称为单分子测序技术可实现对分子直接测序，

且读长较长，一般为几十甚至上百kb,测序通量高，数据可实时读取分析，速度更

快，在临床的应用也越来越多。

大量研究数据表明二代测序技术和第三代测序技术各有所长：二代测序读长短但

准确度高；第三代测序读长长但单碱基准确性稍差。临床应用过程中应依据检测的

主要目的选择适宜的测序技术。

三、开展高通量测序的临床适应证和送检时机

(-)应用高通量测序检测分枝杆菌的适应证

NTM

靶向测序适用于病原学阴性的疑似肺结核、肺外结核、病的诊断及鉴别诊断，

也适用于菌量丰富的临床标本或菌株的耐药基因突变检测，或用于分枝杆菌耐药

的诊断。美格医学的TBseq检测项目可检测46种分枝杆菌分型及19种抗结核

耐药基因和7种抗非结核耐药基因，助力临床精准诊疗！

mNGSNTM

适用于病原学阴性的疑似肺结核、肺外结核、病及其他病原体感染

的诊断及鉴别诊断。

(二)高通量测序检测分枝杆菌病的适宜送检人群及时机

1.

靶向测序检测的适宜送检人群及时机

①疑似肺结核患者，具有典型的肺部影像学改变伴有或不伴有结核病中毒症状，常

规的痰标本抗酸杆菌涂片、培养和GeneXpert