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动物产品中牛、山羊和绵羊源性成分三重实时荧光PCR检测方法
SN/T2980—201
5-ATATGGAATTGCTGAAAGAA(G)-3
3.2.3各探针溶液的使用浓度均为10pmal/L:
a)牛源性成分检测用探针序列及标记物为:
FAM-5-AGCATTTATAGGATACGTCC-3-MGB
b)山羊源性成分检测用探针序列及标记物为:
ROX-5-TCCTGCTCGCAACAATGGC-3-MGB
c)绵羊源性成分检测用探针序列及标记物为:
HEX-5TCCTATTTGCGACAATAGC-3-TAMRA
3.2.4各10mmol/L的四种脱氧核糖核苷酸(dATP,dCTP、dGTP,dTTP)混合溶液。
3.3材料
实时荧光PCR反应管。
4仪器设备
4.1实时荧光PCR检测系统。
4.2核酸蛋白分析仪或禁外分光光度计。
4.31%电子天平。
4.4高速离心机;离心力至少达到12000g。
4.5微量移液器;0.25pL~10pL,10pL~100pL,10gL~200pL.100pL~1000pL。
4.6恒温水溶锅。
4.7微量探荡器。
4.8掌式离心机。
5样品制备
5.1饲料样品按照GB/T14699.1进行采样,将试样充分粉碎,混合均匀后待用。
5.2其他动物产品样品按照SN/T2123进行采样,将试样充分研磨,混合均匀后待用。
5.3固体样品要充分粉碎,保证颗粒大小在100目(即0.125mm)以下。
6DNA提取
6.1样品DNA提取
称取适量样品(50mg~100mg)于1.5mL离心管中,加入600pL~800pL,裂解液1(见附录A),65℃水浴30mim.每隔10min振荡混匀一次;100℃沸水浴5min;12000r/min离心5min,吸取上清液至一新离心管中,加400pL三氧甲烷十异戊醇混合液(见附录A),充分混匀;12000r/min离心5min。吸取上清液至一新离心管中.加0.8信体积的异丙醇,-20℃低温下沉淀DNA30min;12000r/min离心10min,弃去上清液;75%乙醇(见附录A)轻柔地洗涤沉淀一次,12000r/min离心8min,倒去液体,晾干;加人50μL~100pl.的TE(见附录A),充分溶解沉淀。本标准采用直接从牛、山羊和绵羊肉中提取的DNA作为阳性对照模板,因此可参照肉品的DNA提取方法进行阳性对照模板的提取,
6.2DNA浓度和纯度的测定
取5μL的DNA模板溶液加双蒸水稀释至1mL,使用核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计测定
SN/T2980—2011
260nm和280nm处的吸光值A;m和A。DNA的浓度按式(1)计算:
c=A×N×50/1000 (1)
式中:
e—DNA浓度,单位为微克每微升(pg/pL);
A—260nm处的吸光值:
N——核酸稀释倍数。
当As/As比值在1.7~1.9之间时,DNA模板适宜于PCR扩增。
若检测的DNA模板浓度不在规定范围内,可适当增加样品采样量或增加PCR反应中使用的DNA模板量或减少溶解DNA的溶剂的量(浓缩模板,提高浓度),以保证检测的有效性。
7实时荧光PCR检测
7.1反应体系的总体积为50pL…,各引物溶液加2pL,牛、山羊源性检测用探针各加1.5pL,绵羊源性检测用探针加1pL,10×PCR缓冲液加5μl,,TagDNA聚合酶加1μl…样品DNA(25ng/pL.~50ng/pL)加2μL加灭菌双燕水至50μL。
7.2每种样品DNA做两个平行反应,同时设置阳性对照和阴性对照。阳性对照的设置有两种情况,可设置三管阳性对照且分别只含有牛,山羊或绵羊单一源性成分的DNA模板,也可以只设置一管阳性对照且同时加入牛、山羊和绵羊三种源性成分的DNA模板;用等体积的灭菌双蒸水代替模板DNA作为阴性对照。计算需要进行的PCR反应个数n管,按照上述成分比例配制PCR反应体系(n+1)管,然
后等份分装成n管,再依次加入DNA模板液。
7.3将加好反应液的荧光PCR反应管盖紧,快速离心5s
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