许氏平鲉(Sebastesschlegelii)TRAF基因的鉴定及其响应杀鱼爱德华氏菌侵染的表达模式研究_NormalPdf.docxVIP

第55卷第1期海洋与湖沼Vol.55,No.1

2024年1月OCEANOLOGIAETLIMNOLOGIASINICAJan.,2024

许氏平(Sebastesschlegelii)TRAF基因的鉴定及其响应杀鱼爱德华氏菌侵染的表达模式研究*

刘显通王宁宁吴瑞雪李超曹敏①

(青岛农业大学海洋科学与工程学院山东青岛266109)

摘要TRAF是机体内一种具有信息传导作用的胞内因子,承担多个受体家族的信号转导工作,

在固有免疫以及获得性免疫方面都发挥出重要作用。TRAF作为一类胞内接头蛋白,对多条信号途径的活化具有一定的影响,包括细胞的增殖、生存、凋亡、炎症反应、免疫反应等。目前已有研究表明鱼类中的TRAF基因也发挥重要的免疫防疫作用。以许氏平为研究对象,基于基因组和转录组的数据库,进行了许氏平TRAF基因家族的系统鉴定。在许氏平中共鉴定到9个TRAF基因,并对这些TRAF基因的长度和氨基酸个数进行了统计分析。同时,分析了这9个TRAF基因的结构特征。选取了包括许氏平在内的6种鱼类进行了TRAF基因的共线性分析。结果显示,TRAF基因在硬骨鱼类中具有保守的共线性。通过系统发育分析,更好地解析了TRAF家族基因的进化关系,同时也证明了对其鉴定及命名的准确性。此外,还进行了TRAF家族基因的蛋白质相互作用网络预测以及表达模式分析。通过蛋白质相互作用的网络分析,得到TRAF基因与其互作蛋白的关联状况。在杀鱼爱德华氏菌侵染许氏平后的不同时间点,探究TRAF基因在杀鱼爱德华氏菌刺激下的表达模式。定量结果显示,除TRAF4.1外,其他TRAF基因在感染后均存在不同程度的上调。综上所述,从分子水平上揭示了许氏平TRAF家族基因的结构和功能,揭示了TRAF可能依赖的免疫通路,为进一步探究TRAF家族基因在许氏平先天免疫过程中的作用奠定了基础。

关键词TRAF;信号传导;表达模式;许氏平;免疫应答

中图分类号Q789;S965doi:10.11693/hyhz20230700145

肿瘤坏死因子超家族(tumornecrosisfactorsuperfamily,TNFSF)和肿瘤坏死因子受体超家族(tumornecrosisfactorreceptorsuperfamily,TNFRSF)成员参与了多种先天性和适应性免疫过程,对细胞增殖、发育、死亡、存活、免疫和各种疾病起到调节作用(Locksleyetal,2001;Colletteetal,2003)。通常,TNFSF配体通过结合TNFSF同源结构域(THD)和TNFRSF的富半胱氨酸结构域(CRDs)与TNFRSF通信,从而介导免疫相关信号通路和其他发育过程(Bodmeretal,2002)。活化的TNFRSF可以通过肿瘤坏死因子受体相关因子(tumornecrosisfactorreceptor

associatedfactors,TRAF)在胞内进行信号传导(Haetal,2009)。TRAF是一种兼具重要性和特殊性的胞内转导通路分子,可以通过与下游信号分子结合,激活NF-κB信号通路,介导免疫和炎症反应。TRAF作为一种有凝聚性的衔接蛋白,其作用可分为两个方面:一方面,通过TRAF同源域与受体接受外界刺激;另一方面,通过N-端指环/锌指结构与其他蛋白质分子或DNA结合,依靠这两种途径,产生一个较为复杂的下端传递信号(李影等,2015)。

大多数TRAFs成员都含有这样两种结构,N-末端指环状结构域和数目不等的锌指,C-末端TRAF结

*山东省自然科学基金青年项目,ZR2020QC214号。刘显通,硕士研究生,E-mail:2427633799@;同等贡献第一作者:王宁宁,硕士研究生,E-mail:121412