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葡萄苦腐病菌检疫鉴定方法

SN/T2614—2010

附录B

(规范性附录)

分子生物学鉴定

B.1DNA提取方法

样本为植物组织时,将植物组织洗净消毒后切成小块,冷冻加液氮研磨,放入1.5mL.离心管中待用。样本为真菌时,收集菌丝放入1.5mL.浸在液氮里的离心管中,用塑料杵碾碎待用。

离心管加入300μl~500μL.CTAB缓冲液(其中含0.1g蛋白醇K)混匀,65℃水浴1h;13000g离心5min~10min,保留上清液;加500pl.Tris饱和酚:三氯甲烷:异戊醇(体积为25:24:1)混匀,13000g离心5min~10min,保留上清液;再加500yl.三氯甲烷1异戊醇(体积为2411)混匀,13000g离心5min~10min.保留上清液;加入1mL异丙醇混匀,-70℃下放置1h.或-20℃过夜;13000g离心30min,可见DNA沉淀;70%乙醇洗DNA沉淀,室温干燥;用30pL~50μLTrisEDTA缓冲液溶解DNA,待用。

B.2常规PCR检测

特异性引物GUA-1序列为5-GTGGCCCTGTAAACTCTTGT-3,GUA-2

序列为5-GGC-

CGCTAAGTCAACCTAAG-3.

25pl.反应体系中含:样品DNA1pL(1ng~50ng)。10×PCRbuffer

2.5gl,25mmol/1.氯化钱

2pL.2.5mmol/LdNTps2pl.10μmol/L.Primers0.5pL/0.5pL.5U/gl.TagDNApoLymerase

0.2pL.ddH?O16.3pL。同时要设置阴性对照,以Tris-EDTA缓冲液代替DNA样品。

PCR反应条件为:预变性,94℃5min→变性,94℃1min.退火53℃30s,72℃45s,35个循环→

72℃10min→4℃保存。

PCR产物的检测在1XTAE电泳缓冲液中,1.5%琼脂糖凝胶电泳,5V/cm,0.5%EB染色20min,

凝胶成像仪分析结果。

B.3实时黄光PCR检测

实时荧光PCR引物序列为GUA-P1:TCGCGGCTGGAGAAGG,GUA-P2:TCGATGCCAGAAC-

CAAGAGAT,TagMan探针GUA-Probe-117:5°-FAM-TGCCGGTGGCCCTGTAAACTCTTGT-

TAMRA-3。探针5端标记的英光报告基团为FAM,3”端标记的荧光猝灭基团为TAMRA。

25pL反应体系中含;样品DNA1pl,10×PCRbuffer2.5pl,25mmol/L氯化镁2μL.

2.5mmol/LdNTps2pl.,10pmol/L.PrimersIyL/1yL.,10gmel/L探针Probe-1171.5yL..5U/yl.

TagDNApolymerase0.3pl,ddH;O12.7pL。

反应循环为94℃10min→94℃15%,60℃60s循环40次。

SN/T2614—2010

附录C

(规范性附录)

病菌形态图

图C.1分生孢子盘,线长=6μm(采自高清文,1990)

图C.2分生孢子梗及分生孢子,线长=2μm(采自高清文,1990)

SN/T2614—2010

SN/T2614—2010

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