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综述

碱基编辑器的研发及其应用

摘要基因编辑技术可以通过靶向插入、敲除或替换的方法来改变或者修复目的基因。基

于规律成簇间隔短回文重复序列(clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeat,CRISPR)及

其相关蛋白(CRISPR-associated,Cas)开发出的单碱基编辑器(baseeditor,BE)是一类不依赖于DNA

双链断裂便可以实现高效单碱基替换的新一代基因编辑工具,包括胞嘧啶碱基编辑器(CBE)、腺嘌

呤碱基编辑器(ABE)以及腺嘌呤胞嘧啶双碱基编辑器(ACBE)等。碱基编辑器经过一系列的优化

和改进有望为点突变型遗传病患者提供可行的临床治疗新手段。同时,基于锌指(zinc-finger,ZF)、

转录激活样效应因子(transcriptionactivator-likeeffector,TALE)结构开发出的线粒体碱基编辑器填

补了线粒体基因编辑的空白。该文对各类碱基编辑器的研发、优化及分类进行了概述,并总结了

利用碱基编辑器在模式动物小鼠(Musmusculus)和斑马鱼(Daniorerio)中模拟人类点突变遗传病并

进行基因修正编辑的进展,以及碱基编辑工具在植物育种等方面的研究现状。

关键词胞嘧啶碱基编辑器;腺嘌呤碱基编辑器;小鼠;斑马鱼;植物;疾病模型;线粒体编辑;

RNA编辑

DevelopmentandApplicationofGeneBaseEditors

LIUXu,ZHONGZhilin,ZHONGP.Tao*

(ShanghaiKeyLaboratoryofRegulatoryBiology,SchoolofLifeSciences,EastChinaNormalUniversity,Shanghai200241,China)

AbstractGeneeditingtechnologycanmodifyorrepairtargetgenesbytargetedinsertion,knockoutor

replacement.TheBE(baseeditor)developedbyCRISPR(clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicre-

peat)andCas(CRISPR-associated)isanewgenerationofgeneeditingtoolsthathasachievedefficientsinglebase

substitutionwithoutDNAdoublestrandbreaks,includingCBE(cytosinebaseeditor),ABE(adeninebaseeditor),

ACBE(adenineandcytosinebaseeditor).Afteraseriesofoptimizationandimprovement,thebaseeditorsare

expectedtoprovideafeasiblenewmeansofclinicaltreatmentforpatientswithpoint-mutationgeneticdiseases.At

thesametime,themitochondrialbaseeditorbasedonZF(zinc-finger)andTALE(transcriptionactivator-likeef-

fector)structurefillstheblankofmitochondrialgeneediting.Here,thisstudymainlyoverviewsthedevelopment,

optimizationandclassificationofbaseeditors,andsummarizestheresearchprogressofusing