原核生物转录.ppt

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关于原核生物转录转录是细胞生物合成的重要环节,在RNA聚合酶催化下,以ATP、GTP、CTP、UTP为基本原料以DNA为模板依碱基配对原则(G/C,C/G,T/A,A/T)合成RNA的过程。合成方向:5’-3’。模板链称为反义链。非模板链因为和模板链序列反向互补,与子代RNA序列几乎完全相同(除了U代替了T),非模板链又叫编码链。不同基因的模板链与非模板链并非固定在DNA双螺旋分子的某一条链上。第2页,共18页,2024年2月25日,星期天第3页,共18页,2024年2月25日,星期天RNA的转录过程起始延长终止第4页,共18页,2024年2月25日,星期天原核生物中迄今只发现了一种DNA聚合酶,负责所有RNA的合成(包括tRNA,mRNA,rRNA等)。目前结构和机制比较清楚的是大肠杆菌的RNA聚合酶。第5页,共18页,2024年2月25日,星期天大肠杆菌RNA聚合酶的组成σ识别启动子,启动转录α2ββ’ω负责RNA链的延伸β’,β酶的催化活性中心α参与转录速度的调控ω功能尚不清楚第6页,共18页,2024年2月25日,星期天启动子:含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列。原核生物的启动子序列存在着较大差异,但存在着三个共有序列:转录起始识别部位:位于-35区,共有序列是(TTGACA)的6~10bp序列。Pribnow盒:位于-10区,是几乎所有启动子都含有的一个6~8bp的序列,一般为TATAAT。RNA的合成起点:+1区,富含AGGTCCACC序列。转录起始第7页,共18页,2024年2月25日,星期天启动子结构第8页,共18页,2024年2月25日,星期天转录起始RNA聚合酶全酶先与模板以较低的亲和力结合,可以沿着DNA双链滑动,σ亚基识别到启动子序列后,RNA聚合酶紧密结合在DNA模板上,形成转录起始复合物。(此时DNA双链仍处于双联状态,故该复合物被称为闭合转录复合物。)启动子中的普利布诺盒中富含AT碱基,因而碱基容易断裂,RNA聚合酶启动子部位的DNA双联间,发生约17bp的局部裂解,形成开放转录复合物,暴露出DNA模板链。在转录起始部位形成新的RNA第一磷酸二键基,RNA链的第一个核苷酸均为嘌呤A或G。(因为RNA的合成起点,富含AGGTCCACC序列。)第9页,共18页,2024年2月25日,星期天在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应,形成转录起始复合物5?-pppG-OH+NTP?5?-pppGpN-OH3?+ppi第一个核苷三磷酸与第二个核苷三磷酸缩合生成3′-5′磷酸二酯键后,则启动阶段结束,进入延伸阶段转录起始第10页,共18页,2024年2月25日,星期天转录延伸?亚基从全酶中脱落,核心酶变构,与模板结合相对松弛,有利于沿着DNA模板快速前移,继续RNA的合成,RNA链不断延长;2.在这一阶段,DNA分子链不断被打开,完成RNA分子转录后又恢复双链结构,使得DNA分子在电镜下呈现泡状结构,称为转录泡。第11页,共18页,2024年2月25日,星期天转录延伸转录泡第12页,共18页,2024年2月25日,星期天转录终止RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。在原核中,发现终止信号存在于RNA聚合酶已经转录过的序列之中。这种提供终止信号的结构就称为终止子。终止子可分为两类:1、不依赖于蛋白质辅因子就能实现终止作用。2、依赖蛋白辅因子才能实现终止作用。这种蛋白质辅因子称为释放因子,通常又称ρ因子。第13页,共18页,2024年2月25日,星期天两类终止子有共同的序列特征:在转录终止点前有一段回文序列,回文序列的两个重复部分(每个7~20bp)由几个不重复的核苷节段隔开。两类终止子的不同点:不依赖ρ因子的终止子的回文序列中富含GC碱基对,在回文序列的下游方向又常有6~8个AT碱基对(在模板链上为A、在mRNA上为U);而依赖ρ因子终止子中回文序列的GC对含量较少。在回文序列下游方向的序列没有固定特征,其AT对含量比前一种终止子低。转录终止第14页,共18页,2024年2月25日,星期天不依赖ρ的转录终止不依赖P因子的序列中富含GC碱基对,由此形成的RNA转录子链能够通过形成氢键结构形成茎-环发卡结构,在此部分的DNA和RNA杂化链很不稳定,使RNA从模板上脱落

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