分子力学方法.ppt

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2024-05-10 发布于广东
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分子力学方法第21页,共32页，2024年2月25日，星期天Therearethreeaspectsimportantinthedeterminationofanappropriateforce-fieldfordeterminingenergychangesthatoccurwhenaninhibitorbindstoamagnetitesurfaceandformsatwodimensionalfilm.Thesearethefollowing:Theforce-fieldshouldaccuratelydescribethestructureofmagnetite.2)Itshoulddescribeinhibitorsurfaceironatominteractionsaccurately.3)Itshoulddescribetheinteractionsbetweeninhibitormoleculesaccurately.分子力学方法第22页,共32页，2024年2月25日，星期天FIGURE1-The(111)millerplaneofFe3O4.ThesurfaceFe2+sitesareinblack.O2-anionsareinwhitewhiletheFe3+areingray.ThehexagonalspacingofsurfaceFe*+sitesishighlightedinthediagram.FIGURE2-Wateronthe(11i)millerplaneofFesOd,Thedistancebetweentheoxygenatomofwaterandam-faceFe*+siteisshowninthediagram.分子力学方法第23页,共32页，2024年2月25日，星期天分子力学方法第24页,共32页，2024年2月25日，星期天IAIB图11-羟乙基-2-十七烷基咪唑啉(IA)和1-氨乙基-2-十七烷基咪唑啉(IB)的优化分子结构Figure1Optimizedmolecularstructures:1-hydroxyethyl-2-heptadecylimidazoline(IA)and1-aminoethyl-2-heptadecylimidazoline(IB).咪唑啉缓蚀剂缓蚀性能的理论研究分子力学方法第25页,共32页，2024年2月25日，星期天IAIBEHOMO=-5.27evEHOMO=-5.10ev图2IA和IB缓蚀剂分子的最高占有轨道，等值面数值为0.02a.u.Figure2Highestoccupiedmolecularorbital(HOMO)withavalueofisosurfaceof0.02a.u.forIAandIB.IAIBELUMO=1.27evELUMO=1.43ev图3IA和IB缓蚀剂分子的最低未占轨道，等值面为0.02a.u.Figure3Lowestunoccupiedmolecularorbital(LUMO)withavalueofisosurfaceof0.02a.u.forIAandIB.2.1分子反应活性的量子化学计算分子力学方法第26页,共32页，2024年2月25日，星期天分子的反应活性点位可通过Fukui指数来分析，Fukui指数不仅可以测定分子的化学活性点位和强弱，同时还可以确定活性点位的亲核或亲电子的特性。分子原子IA1C-0.287-0.283-0.297-0.0040.0142C-0.290-0.319-0.3480.0290.0293C0.1320.4310.450-0.299-0.0194N-0.530-0.496-0.276-0.034-0.2207N-0.657-0.491-0.277-0.166-0.2148C-0.285-0.289-0.3160.0040.02711C-0.149-0.153-0.1440.004-0.00914O-0.677-0.661-0.622-0.016-0.039IB1C-