染色质免疫共沉淀ChIP技术.pdf

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2023/5/207:39染色质免疫共沉淀ChIP实验技术服务ChIP-qPCR/ChIP-seq实验外包公司-辉骏生物

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ChIP(chromatinimmunoprecipitationassay,染色质免疫共沉淀)是研究体内DNA与蛋白结合的重要技术,主要包括ChIP-qPCR和ChIP-seq两种;其中ChIP-

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qPCR用来验证与目标蛋白结合的已知DNA片段,ChIP-seq用来筛选与目标蛋白结合的未知DNA片段。

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染色质免疫沉淀ChIP实验原理

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先用甲醛交联细胞内“蛋白-DNA”复合物,并用超声波破碎DNA至适合的长度。细胞裂解后,孵育结合了抗体的珠子,诱饵蛋白通过其抗体便结合到了Beads上,

同时和诱饵蛋白互作的DNA,也一起沉淀到Beads上。洗涤掉未结合的DNA后,再用洗脱液将DNA-蛋白复合物从Beads洗脱下来,便得到染色质免疫共沉淀产物。

DNA-蛋白复合物去交联后,既可qPCR检测已知DNA片段,也可用二代测序与蛋白互作的DNA片段。

当没有合适的诱饵蛋白抗体时,可以通过表达融合了flag标签的诱饵蛋白,利用flag标签做免疫沉淀。即细胞过表达Flag-Bait,经裂解后与anti-Flag珠子孵育,诱饵

融合蛋白与Beads结合,与诱饵融合蛋白互作的DNA“共沉淀”到Beads上,再经洗涤、洗脱后做qPCR或NGS测序。

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染色质免疫沉淀ChIP实验流程

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2023/5/207:39染色质免疫共沉淀ChIP实验技术服务ChIP-qPCR/ChIP-seq实验外包公司-辉骏生物

带标签的染色质免疫共沉淀流程图:

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