SNP分型技术简介3(高遄).ppt

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SNP分型技术简介;SNP;1.SNP概念;1.SNP概念;2.SNP分类;3.SNP特性;3.SNP特性;4.SNP研究意义;4.1基因组制图;4.2疾病的关联分析;4.3药物设计和应用;4.4个体识别和亲权鉴定;5.SNP分型技术;5.1经典检测方法;限制性片段长度多态性法PCR-RFLP;限制性片段长度多态性法PCR-RFLP;限制性片段长度多态性法PCR-RFLP;限制性片段长度多态性法PCR-RFLP;单链构象多态性法PCR-SSCP;;单链构象多态性法PCR-SSCP;5.2基于PCR的方法;等位基因特异PCR(AS-PCR);等位基因特异PCR(AS-PCR);等位基因特异PCR(AS-PCR);等位基因特异PCR(AS-PCR);5.3基于杂交荧光检测的方法;5.3.1TaqMan技术;5.3.1TaqMan技术;5.3.1TaqMan技术;连接酶检测〔LDR〕;连接酶检测〔LDR〕;连接酶检测〔LDR〕;连接酶检测〔LDR〕;基因芯片;这5个亚序列依次错开一个碱基而重叠7个碱基。

亚序列中A、T、C、G4个碱基自由组合而形成的所有可能的序列共有65536种。

假设只考虑完全互补的杂交,那么48个8nt亚序列探针中,仅有上述5个能同靶DNA杂交。

可以用人工合成的序列的所有可能的n体寡核苷酸探针与一个未知的荧光标记DNA/RNA序列杂交,通过对杂交荧光信号检测,检出所有能与靶DNA杂交的寡核苷酸,从而推出靶DNA中的所有8nt亚序列,最后由计算机对大量荧光信号的谱型〔pattern〕数据进行分析,重构靶DNA的互补寡核苷酸序列。;;;特点:

优点:信息量大;自动化程度高。

局限性:芯片造价高昂,所需设备贵重,不利于普及应用。

;5.4光谱或电子信号;直接测序法;总结;参考文献;ThankYou!;

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