地理探测器使用教程.docx

地理探测器使用教程

一、Excel插件版本

用Excel编制的地理探测器软件，可从以下网址免费下载：/。

地理探测器使用步骤包括：

（1）数据的收集与整理：这些数据包括因变量Y和自变量数据X。自变量应为类型量；如果自变量为数值量，则需要进行离散化处理。离散可以基于专家知识，也可以直接等分或使用分类算法如K-means等。

（2）将样本（Y,X）读入地理探测器软件，然后运行软件，结果主要包括4个部分：比较俩区域因变量均值是否有显著差异；自变量X对因变量的解释力；不同自变量对因变量的影响是否有显著的差异，以及这些自变量对因变量影响的交互作用。

表1GeoDector数据输入格式

Y

X1

X2

…

Xm

y1

x11

x12

…

x1m

y2

x21

x22

…

x2m

…

…

…

…

…

yn

xn1

xn2

…

xnm

图1地理探测器软件用户界面

二、R语言包版本

教程原文：/web/packages/geodetector/vignettes/

geodetector.html#factor-detector

geodetector包涵盖五个函数：factor_detector，interaction_detector，risk_detector，ecological_detector和geodetector。前四个功能实现因子探测器，交互探测器，风险探测器和生态探测器的计算，可以使用表数据计算，例如csv格式（表2）。最后一个函数geodetector是一个辅助函数，可用于实现shapefile格式映射数据的计算（图2）。

表2表格示例数据

incidence

watershed

soilttype

elevation

7.20

2

3

6

7.01

2

3

6

6.79

2

3

6

6.73

4

3

6

6.77

4

3

1

6.74

4

3

6

geodetector包依赖于以下包：rgeo、sp、maptools和rgdal，需要提前安装。

作为演示，提供了村庄的神经管出生缺陷（NTD）Y和疑似风险因素或其指标X，包括健康影响GIS图层和环境因素GIS图层：“海拔”、“土壤类型”和“流域”。

图2GIS格式演示数据（a）NTDs流行率Y，（b）海拔X1，（c）土壤类型X2，（d）流域X3

下载geodetector包后，使用install.packages函数安装。

install.packages(geodetector)????

加载包：

library(geodetector)??

以表格格式读取数据：

data(CollectData)??

数据类：

class(CollectData)??

##?[1]?data.frame??

字段名称：

names(CollectData)??

##?[1]?incidence?watershed?soiltype??elevation??

2.1因子探测器

因子探测器q统计量衡量YY的SSH，或Y的协变量X的行列式幂。

factor_detector实现因子探测器的功能。在下面的演示中，第一个参数“incidence”代表解释变量，第二个参数“elevation”代表解释变量，第三个参数“CollectData”代表数据集。

该函数的输出包括q统计量和相应的p值。

factor_detector(incidence,elevation,CollectData)???

##?[[1]]??

##???????????q-statistic????p-value??

##?elevation???0.6067087?0?

也可以用另一种方式来实现该功能，其中输入参数可以是每个字段的索引。例如，在下面的演示中，第一个参数“1”表示数据集第一列中的解释变量，第二个参数“3”表示数据集第三列中的解释变量。

factor_detector(1,3,?CollectData)??

##?[[1]]??

##??????????q-statistic???p-value??

##?soiltype???0.3857168?0.3632363??

如果有多个变量，该函数可以如下使用。其中，c(“soiltype”,“watershed”,“elevation”)或c(2,3,4)分别为第2、3、4列解释变量的字段名和字段索引。

factor_detector?(incidence,c(soiltype,watershed,elevation),CollectData)?

或者

factor_detector?(1,c(2,3,4),?CollectData)??

##?[[1]]??

##???????????q-statistic???