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生物信息的传递(上)—从DNA到RNA
基因表达:是基因经过转录、翻译、产生有生物活性的蛋白质的整个过程。
转录(transcription):以DNA为模板,按照碱基互补原则合成一条单链RNA,从而将DNA中的遗传信息转移到RNA中去的过程称为转录。
编码链(codingstrand)=有意义链
模板链(templatestrand)=反义链
不对称转录(asymmetrictranscription):转录仅发生在DNA的一条链上。
启动子(promoter):是DNA转录起始信号的一段序列,它能指导全酶与模板正确的结合,并活化酶使之具有起始特异性转录形式。
终止子(terminator):转录终止的信号,其作用是在DNA模板特异位置处终止RNA的合成。
转录单位:DNA链上从启动子直到终止子为止的长度称为一个转录单位。
3.1RNA的转录
转录的基本过程都包括:模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止.
1、模板识别阶段主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。转录起始前,启动子附近的DNA双链分开形成转录泡以促使底物核糖核苷酸与模板DNA的碱基配对。
2、转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生。
3、转录起始后直到形成9个核苷酸短链是通过启动子阶段,通过启动子的时间越短,该基因转录起始的频率也越高。
4、RNA聚合酶离开启动子,沿DNA链移动并使新生RNA链不断伸长的过程就是转录的延伸。
5、当RNA链延伸到转录终止位点时,RNA聚合酶不再形成新的磷酸二酯键,RNA-DNA杂合物分离,这就是转录的终止.
3。1。1转录的基本过程
RNA合成的基本特点:
1。底物是:ATP、GTP、CTP、UTP
2。在聚合酶作用下形成磷酸酯键
3。RNA的碱基顺序由DNA的顺序决定
4.仅以一条DNA链作为模板
5。合成方向为5’→3’
6.合成中不需要引物
3。1。2转录机器的主要成分
原核生物RNA聚合酶:
亚基基因相对分子量亚基数组分功能
αrpoA3。65×1042核心酶核心酶组装,
启动子识别
βrpoB1。51×1051核心酶β和β’共同形成
RNA合成的活性中心
β’rpoC1.55×1051核心酶
?11×1041核心酶未知
σrpoD7。0×1041σ因子存在多种σ因子,用
于识别不同的启动子
1、RNA聚合酶
大多数原核生物RNA聚合酶的组成是相同的,大肠杆菌RNA聚合酶由2个α亚基、一个β亚基、一个β亚基和一个ω亚基组成,称为核心酶。加上一个σ亚基后则成为聚合酶全酶(holoenzyme),相对分子质量为4.65×105。研究发现,由β和β’亚基组成了聚合酶的催化中心,它们在序列上与真核生物RNA聚合酶的两个大亚基有同源性。β亚基能与模板DNA、新生RNA链及核苷酸底物相结合.
σ因子可以极大地提高RNA聚合酶对启动子区DNA序列的亲和力,加入σ因子以后,RNA聚合酶全酶识别启动子序列的特异性总共提高了107倍。
σ因子的作用是负责模板链的选择和转录的起始,
转录的起始从化学过程来看是单个核苷酸与开链启动子—酶复合物相结合构成新生RNA的5’端,再以磷酸二酯键的形式与第二个核苷酸相结合,起始的终止反映在σ因子的释放.过去认为二核苷酸的形成就是转录起始的终止,实际上,只有当新生RNA链达到6-9个核苷酸时才能形成稳定的酶-DNA-RNA三元复合物,才释放σ因子,转录进入延伸期.
真核生物RNA聚合酶
真核生物中共有3类RNA聚合酶。真核生物RNA聚合酶一般有8-14个亚基所组成,相对分子质量超过5×105。
除了细胞核中的RNA聚合酶之外,真核生物线粒体和叶绿体中还存在着不同的RNA聚合酶.线粒体RNA聚合酶只有一条多肽链,相对分子质量小于7×104,是已知最小的RNA聚合酶之一,与T7噬菌体RNA聚合酶有同源性。叶绿体RNA聚合酶比较大,结构上与细菌中的聚合酶相似,由多个亚基组成,部分亚基由叶绿体基因组编码
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