HMGN基因家族在肝癌中的表达及预后价值的分析.pdfVIP

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岭南现代临床外科2023年4月第23卷第2期LingnanModernClinicsinSurgery,April.2023,Vol.23No.2111

HMGN基因家族在肝癌中的表达及预后

价值的分析

蔡典葵,李昂,杨思加,韦金星,闵军*

[摘要]目的本研究旨在通过生物信息学方法分析肝癌中HMGN基因家族的表达水平

及其与临床预后的关系。方法应用TCGA和GEO数据库,分析HMGN家族各成员在肝癌

组织与正常组织的表达水平,并进一步分析HMGN家族在肝癌不同分期的表达水平。然

后,HMGN基因家族的表达水平与肝癌患者的预后相关性通过GEPIA数据库进行分析。

最后,利用LASSO分析,构建肝癌预后风险模型,并评价模型的预测效果。结果在肝癌

组织中,HMGN1、HMGN2和HMGN4的表达水平显著高于正常组织。肝癌Ⅰ期的HMGN1、

HMGN2、HMGN3和HMGN4的表达水平显著低于Ⅱ期和Ⅲ期。HMGN1、HMGN2和HMGN4

的表达水平与肝癌患者的总体生存率呈负相关。HMGN1、HMGN2、HMGN3和HMGN4的表

达水平与肝癌患者的无病生存率呈负相关。基于HMGN2、HMGN3和HMGN4的预后风险

模型可评估肝细胞癌患者的预后。结论HMGN1、HMGN2和HMGN4可能成为肝癌新的诊

断和治疗靶点。

[关键词]HMGN;肝癌;生物标志物;生物信息学;预后

doi:10.3969/j.issn.1009⁃976X.2023.02.004中图分类号:R735.7文献标识码:A

ExpressionandprognosticvalueofHMGNgenefamilyinhepatocellularcarcinoma

CAIDian⁃kui,LIAng,YANGSi⁃jia,WEIJin⁃xing,MINJun

DepartmentofHepatobiliarySurgery,SunYat⁃SenMemorialHospital,SunYat⁃SenUniversity,Guang⁃

zhou,510120,China.

Correspondingauthor:MINJun,minjun@mail.sysu.edu.cn

[Abstract]ObjectiveThepurposeofthisstudywastoanalyzetheexpressionlevelofHMGNgene

familyinhepatocellularcarcinoma(HCC)anditscorrelationwithclinicalprognosisbybioinformatics

method.MethodsTheTCGAandGEOdatabasewasusedtoanalyzetheexpressionlevelofHMGN

familymembersinHCCtissuesandnormallivertissue,andtofurtheranalyzetheexpressionlevelof

HMGNfamilymembersindifferentstagesofHCC.Then,thecorrelationbetweentheexpressionlevelof

HMGNgenefamilyandprognosisofHCCpatientswasanalyzedbyGEPIAdatabase.Finally,prognostic

riskmodelofHCCwasconstructedbyLASSOanalysis,andthepredictioneffectofthemodelwasevalu⁃

ated.ResultsTheexpressionlevelsofHMGN1,HMGN2andHMGN4inHCCtissuesweresignificant⁃

lyhigherthanthoseinnormaltissues.TheexpressionlevelsofHMGN1,HMGN2,HMGN3andHMGN4

instageⅠofHCCweresignificantlylowerthanthoseinstageⅡandStageⅢ.Theexpressionsof

HMGN1,HMGN2andHMGN4werenegativelycorrelatedwiththeoverallsurvivalofpatientswith

HCC.TheexpressionofHMGN1,HMGN2,HMGN3andHMGN4wasnegative

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