维氏气单胞菌tmRNA以sRNA形式特异调控的下游靶标筛选和鉴定 (1).pdf

微生物学报

ActaMicrobiologicaSinica

ISSN0001-6209,CN11-1995/Q

《微生物学报》网络首发论文

题目：维氏气单胞菌tmRNA以sRNA形式特异调控的下游靶标筛选和鉴定

作者：童园，罗宸，柏泰鹏，唐燕琼，刘柱，马香

DOI：10.13343/ki.wsxb

收稿日期：2024-02-20

网络首发日期：2024-06-04

引用格式：童园，罗宸，柏泰鹏，唐燕琼，刘柱，马香．维氏气单胞菌tmRNA以sRNA

形式特异调控的下游靶标筛选和鉴定[J/OL]．微生物学报.

/10.13343/ki.wsxb

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发论文视为正式出版。

网络首发时间：2024-06-0409:33:07

网络首发地址：/urlid/11.1995.Q1427.001

DOI:10.13343/ki.wsxb

研究报告

维氏气单胞菌tmRNA以sRNA形式特异调

控的下游靶标筛选和鉴定

童园，罗宸，柏泰鹏，唐燕琼，刘柱，马香*

海南大学生命健康学院，海南海口570228

摘要：转移-信使RNA(transfer-messageRNA,tmRNA)是细菌中普遍存在的稳定非编

码sRNA，同时具备tRNA和mRNA双重特性，主要介导反式翻译核糖体拯救机制，对

病原菌致病性和胁迫响应具有重要影响。【目的】从tmRNA功能研究入手，揭示对水

产养殖和人类公共安全造成严重危害的维氏气单胞菌(Aeromonasveronii)的致病分子机

制。【方法】采用生物学信息学工具IntaRNA2.0对维氏气单胞菌tmRNA可能结合的下

游靶标进行预测，通过基因本体论(GeneOntology,GO)和京都基因与基因组百科全书

(KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes,KEGG)富集分析初步鉴定预测靶标参与的生

物学过程及信号通路，并使用qPCR技术验证候选靶标基因在维氏气单胞菌野生型、

tmRNA敲除株和smpB敲除株中的表达情况，以初步鉴定维氏气单胞菌tmRNA以sRNA

形式调控的潜在下游靶标。【结果】tmRNA有可能以sRNA形式与下游100个潜在特

异性靶标结合，这些靶标基因主要结合于tmRNA