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三种核酸的提取及比较
摘要:分别以绿豆芽幼叶、含100ug/mL氨苄青霉素的LB培养基培养的细菌和绿豆芽幼叶
为材料进行总DNA、质粒DNA和RNA的提取的试验比较,结果表明:用上述的材料可以
提取到较高质量的总DNA,质粒DNA和RNA。
关键词:总DNA,质粒DNA,RNA,提取,检测,电泳
现在,对基因组DNA,质粒DNA,RNA含量的研究已经是成为一种普遍。大
豆作为我国乃至全世界重要的作物,国内外已开展了大量的基础生物学研究和分
子辅助育种研究,以绿豆幼叶提取基因组DNA、以绿豆幼叶提取RNA,是一种
不错的选择,因为在大豆幼嫩叶片中有高含量的DNA,对于基因组DNA、RNA
的全部提取实现率较高。而质粒DNA的提取,我们则选用了、含100ug/mL氨
苄青霉素的LB培养基培养的细菌为材料。
1材料与仪器
1.1实验材料
豆芽,LB培养基菌体
1.2仪器设备
高速冷冻离心机、液氮罐、恒温水浴锅、紫外分光光度计、冰箱、移液枪、PH试纸、高压
灭菌锅、电泳槽等
2试剂
2.1总DNA提取的试剂
2.1.1裂解液100mmol/LTris-HCL(pH8.0),5mmol/LEDTA,500mmol/LNaCl,1.25%SDS,
1%巯基乙醇,1%PVP(聚乙烯吡咯烷酮)。
2.1.2苯酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)
2.1.33mol/LNaAc(用冰醋酸调PH至5.2)
2.1.4TE缓冲液100mmol/LTris-HCL(pH8.0),10mmol/LEDTA,配成母液储存。使用
前稀释10倍成为工作液。
2.1.5异丙醇
2.1.6氯仿
2.1.75mg/mLRnase,用水溶解后煮沸10至15min,冷却后贮于-20°C备用。
2.2质粒DNA提取的试剂
2.2.1溶液I50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris-HCL(pH8.0),10mmol/LEDTA,灭菌后保存于
冰箱中备用。
2.2.2溶液II0.2mol/LNaOH,1%SDS,现配现用。
2.2.3溶液III5mol/LKac60mL,冰乙酸11.5mL,水28.5mL,混匀后存入冰箱备用。
2.2.4LB培养基购现成或按配方配制后分装,灭菌后备用。
2.2.5其他试剂TE缓冲液;溶菌酶;异丙醇;50mg/mL氨苄青霉素;苯酚-氯仿-异戊醇
(25:24:1);3mol/LNaAc(pH5.2,灭菌后保存);75%乙醇;分装后存入冰箱中保存备用。
2.3RNA提取的试剂
2.3.1变性液4mol/L异硫氰酸胍,0.5%SDS,0.5%Sarcosyl(N-肉桂酰肌酸钠),100mmol/L
巯基乙醇,溶于42mmol/L醋酸缓冲液(pH4.2)中,可在65°C加热助溶,过滤后灭菌备
用,可在冰箱中较长时间保存。
2.3.22mol/LNaAc(pH4.0)NaAc16.4g加水70mL,用冰乙酸调至pH4.0,最后定容至100mL.
2.3.3苯酚(酸性酚)-氯仿-异戊醇(25:24:1).
2.3.4其他试剂异丙醇(于冰箱中预冷)
2.3.50.05%DEPC水溶液1000mL重蒸水加入0.5mL的DEPC,装于棕色瓶中备用,较长
时间保存应放入冰箱中。
2.4电泳试剂
2.4.1TBE电极缓冲液
(1)储存的母液(5XTBE缓冲液)Tris54g,硼酸27.5g,0.5mol/LEDTA(Ph8.0)20mL,溶
于蒸馏水中定容至1000mL。置于4°C下可储存备用,其pH约为8.3.
(2)电泳时的缓冲液(0.5XTBE缓冲液)临用时用水稀释5XTBE缓冲液至0.5XTBE
缓冲液(10倍稀释)。
2.4.20.8%琼脂糖琼脂糖0.32g溶于0.5XTBE缓冲液40mL,微波炉加热融化。
2.4.3Goldview染料。
2.4.4RnaseA(RNA酶A)不含DNA酶RNaseA的10mg/mL,TE配制,沸水加热15分
钟,分装后储存于-20°C。
2.4.56Xloadi
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