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仁用杏资源的SSR遗传多样性评价的开题报告
一、选题背景及意义
杏是我国古老的果树之一,被誉为“东方第一果”。它因其丰富的
营养价值和药用价值,备受人们的喜爱。然而,由于经济利益的驱动,
过度开发和不合理利用已引起了杏枯病、杏核桃壳腐病等病害的流行,
严重危害了杏树资源的利用和保护。近年来,学者们利用分子生物学技
术开展杏树遗传多样性研究,以期为杏树资源的保护和育种提供更为可
靠的理论基础和实践手段。
二、研究目的和内容
本研究旨在基于杏树SSR分子标记技术,对杏树资源的遗传多样性
进行评价,揭示不同杏树地理种源和产区之间的遗传多样性差异,为杏
树资源的保护和育种提供科学依据。具体的研究内容包括:
1.采集不同地理环境下的杏树样品,筛选SSR分子标记,建立杏树
遗传多样性评价方法;
2.利用SSR分子标记技术对不同地理种源和产区之间的遗传多样性
差异进行评价,构建杏树遗传多样性遗传多样性地图;
3.基于遗传多样性数据分析,探讨影响杏树遗传多样性的相关因素,
为杏树资源的保护和育种提供科学依据。
三、理论基础和方法流程
1.理论基础
利用SSR(SimpleSequenceRepeat)分子标记评价杏树的遗传多
样性是一种基于分子生物学技术的遗传评价方法。SSR是由2-6个核苷酸
短序列(单元)组成的简单序列重复,它具有高度的多态性、稳定性、
重复性和高复合度等优点,可用于遗传多样性评价、种质资源鉴定、亲
缘关系分析等领域。
2.方法流程
(1)实验设计
选择不同种源、不同产区的杏树样品,采集样品叶片或幼苗组织进
行DNA提取和PCR扩增。
(2)DNA提取
利用CTAB法或柱式法等方法提取样品中的全基因组DNA。
(3)SSR扩增
设计杏树SSR引物,利用PCR扩增样品DNA中的SSR序列。根据
扩增结果进行芯片或者测序分析。
(4)数据分析
根据SSR扩增结果构建杏树遗传多样性地图,根据多态性指数、遗
传距离等指标,评价不同地理种源和产区的遗传多样性差异。使用聚类
分析和主成分分析等方法分析影响杏树遗传多样性的相关因素。
四、研究的预期成果和意义
(1)能够全面评价不同地理种源和产区杏树的遗传多样性,并构建杏
树地理种源和产区遗传多样性图谱,进一步揭示遗传多样性分布和资源
分布格局;
(2)探讨了影响杏树遗传多样性的相关因素,并为杏树资源的保护和
育种提供科学依据;
(3)对珍贵杏树资源的遗传保护提供了有力的支持,为推动我国果树
资源的有序开发和可持续利用提供了重要的理论基础。
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