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第四章RNA的结构;分子生物学的中心法则(centraldogma);中心法则的补充和发展;1981年,切赫(T·R·Cech)等人在四膜虫发现自催化剪切的tRNA。1983年阿尔特曼(S·Altman)领导的一个研究小组发现大肠杆菌的核糖核酸P的催化活性取决于RNA而不是蛋白质。这意味着RNA可以不通过蛋白质而直接表现出本身的某种遗传信息,而这种信息并不以核苷酸三联体来编码。这是对中心法则的又一次补充和发展。切赫和阿尔特曼荣获1989年的诺贝尔化学奖。;1994年,乔依斯(G·F·Joyce)等人发现一个人工合成的DNA分子具有一种特殊的磷酸二酯酶活性。此后,国外又有多例报道人工合成的DNA序列具有各种不同的酶活性。
1995年,我国学者王身立等人发现,从多种生物中提取的DNA均具有酯酶活性,能催化乙酸萘酯水解为萘酚和乙酸。这种较弱的酯酶活性并不需要特定序列的DNA编码,而是非特异性DNA的一般性质。王身立推测,在生命起源时,RNA和蛋白质都还未出现,原始海洋营养汤中的DNA可能利用本身的酯酶活性水解萘酯等物质以获得能量。随着生命的进化,酶活性更强的蛋白质出现了,在生命世界中DNA作为酶的作用则为蛋白质所取代。但DNA分子本身的酯酶活性仍作为一种“分子化石”的遗迹,一直保存到今天。;第一节RNA和DNA的结构差异;组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为β-D-2-脱氧核糖;RNA所含的糖则为β-D-核糖。;当核苷酸寡聚形成RNA时,2’位的羟基是游离的,这个游离的羟基使得RNA的化学性质不如DNA稳定,也使得RNA较DNA能产生更多的修饰组分
RNA除了生成3’,5’-磷酸二酯键外还可以跟核苷酸生成2’,5’-磷酸二酯键
;在RNA中为尿嘧啶残基。尿嘧啶与胸腺嘧啶的区别仅仅在于嘧啶环的C5位上,后者相当于前者的甲基取代衍生物,由于甲基基团的引入,通过空间效应和电子效应产生一定的影响,致使U有别于T
;从氢键的相互作用看,尿嘧啶和胸腺嘧啶具有相同的参与碱基配对的氢键作用位点,且尿嘧啶除了跟A配对外,还可以跟G配对,这对于RNA链形成稳定的特征性自身折叠结构起着一定的作用。
U和T在N1,C2,N3,C4,C5,C6,O2,和O6位置上有着几乎相同的原子静电荷;第二节RNA的结构特征;RNA主要是负责DNA遗传信息的翻译和表达,分子量要比DNA小得多。RNA为单链分子。少数RNA病毒RNA为双链分子。主要存在于细胞核、细胞质。
;根据RNA的功能,可以分为mRNA、tRNA、rRNA、hnRNA、snRNA、SnoRNA。
它们在遗传信息的传递、表达和调控过程中承担着不同的角色,执行不同的功能。
;(1)、mRNA(信使RNA);(2)tRNA(转移RNA);(3)rRNA(核糖体RNA);随着具有酶功能的RNA(核酶)、反义RNA的发现以及对核不均一RNA(heteronuclearRNA,hnRNA)和核小分子RNA(smallnuclearRNA,snRNA)等的研究深入,一幅绚丽多姿、和谐美妙的RNA多样性图像展现在我们面前。
复杂性???
从分析和综合的角度,沿着遗传信息传递的途径,从转录和反转录两方面来揭示为何一个双螺旋DNA分子经过转录会产生如此多种多样的RNA分子,以及这些RNA分子在调控条件下又是如何协调作用,并反转录为DNA分子的。;20世纪90年代以来,一系列新的核仁小分子RNA(smallnucleolusRNA,SnoRNA)的发现及其在核糖体生物合成中调控作用的确定,在RNA分子生物学领域刮起了“核仁风暴”。通过对SnoRNA结构与功能的研究,使真核生物rRNA加工中的一系列重大难题(加工体系的构成、修饰核苷生成原理、正确的分子折叠及构型转变等)取得了突破,揭示了真核生物核糖体生物合成过程中复杂的基因表达体系与调控机制。;19;RNA的多样性包括结构的多样性和功能的多样性。相对于RNA的一维线性结构的多样性而言,其单链自身回折形成的特征性二级结构和高级结构的多样性更具吸引力和富于挑战性。
;值得注意的是:;第三节RNA的一级结构;RNA的测序;酶水解:;RNA的末端分析
5’末端分析:先用PMase去掉RNA端点核苷酸的游离磷酸根,露出-OH,再用多核苷酸激酶和放射性同位素P32(简记为γ-P32)标记过的ATP,将RNA5’末端核苷酸的5’位上接上γ-P32,这样就把5’端核苷酸标记了。稀氨水彻底水解RNA,电泳,放射自显影,标准图谱对照,可知该核苷酸的种类。
3’末端分析:操作同上,在电泳图谱上找出核苷的位置。对照标准图谱,可知该核苷酸的种类。;RNA片段测序:将这个RNA片段的5’端进行标记(P32)
4种RNA内切酶进行不同步的作用(解释:每
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