ThermoFishe cfTNA Panel 验证方案学习.pptx

OncomineLungCell-FreeTotalNucleic

AcidResearchAssay验证分析

1描述

OncomineLungcfTNA检测从全血血浆组分中分离的肺癌肿瘤来源无细胞DNA和RNA(无细胞总

核酸；cfTNA)。其提供了文库构建试剂，以及用于从单管10mL全血的血浆组分中获得的cfTNA

制备扩增子文库的多重PCR引物池。

1.优势

1

侵入性较小，可在多个时间点采集样品以监测癌症进展

⚫

成本较低

⚫

从样品到结果的周转时间更短

⚫

更好地表示肿瘤异质性

⚫

检测类型

1.

2热点基因和短插入缺失：、、、、、、、

⚫(SNV)ALKBRAFEGFRERBB2KRASMAP2K1MET

NRAS、PIK3CA、

ROS1和TP53(覆盖~168个热点)

基因融合：、、

⚫ALKRETROS1

外显子跳跃

⚫MET14

拷贝数基因：

⚫(CNV)MET

检测下限

1.

3

20ngcfDNA起始量下：

对于短插入缺失，可实现为、灵敏度为、特异性

⚫SNV/LOD0.1%~90%99%

对于融合和外显子跳读，可实现为、灵敏度为、特异性

⚫METLOD1%90%99%

对于靶标，可实现检测低至倍扩增、灵敏度为、特异性

⚫METCNV1.290%99%

分析方法

2

整个工作流程，从使用MagMAX无细胞总核酸分离试剂盒分离cfTNA到样品分析，可使用

IonS5XL测序系统在两天内完成。

实验流程

2.

1