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实例:对GFAP人胶质纤维酸性蛋白(glialfibrillaryacidicprotein)进行结构与功能预测;网址:;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;;总结:GFAP为一中等分子量的酸性蛋白,分子中含有较多的Glu,每个分子大约带9个负电荷。该蛋白无跨膜区域,并且亲水,不是膜蛋白。GFAP是一种结构蛋白,属于IF家族,主要参与中间纤维的构成,在神经元内环境的维持和血脑屏障中起着重要作用。到目前为止,该蛋白的空间结构尚未解析出来,有待于进一步研究。;作业;1、对该段序列进行同源性搜索
2、对该段序列进行基本性质分析:蛋白质的氨基酸组成、等电点、相对分子质量、亲水性、疏水性、消光系数、信号肽、跨膜区域等。
3、分析该段序列的MOTIF
4、对该段序列进行三维结构的分析
5、分析该序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的代谢途径、相互作用的蛋白,以及与疾病的相关性。
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