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1§2.1结构特征§2.2种类§2.3主要化学性质§2氨基酸/AminoAcids
2R=“Remainderofthemolecule”结构通式为什么羧基不写成COOH,氨基不写成NH2?或
3Dextrorotary,Levorotary与甘油醛比较定D/L构型
4Thehorizontalbondsprojectoutoftheplaneofthepaper,theverticalbehind.Perspectiveformulas透视式projectionformulas费歇尔(Fischer)投影式通常使用费歇尔(Fischer)投影式
5除少数列外,大多数氨基酸只有α-carbon是手性碳原子。绝大多数蛋白质中的氨基酸是L-AAs,D-AAs在细菌细胞壁的肽聚糖以及抗菌肽中出现。氨基酸的D,L构型与其具体的旋光性(左旋还是右旋?)没有直接对应关系。小结
6§2.1结构特征§2.2种类§2.3主要化学性质§2氨基酸/AminoAcids
7StandardAAs:L-enantomerdirectlyincorporatedintoaproteinNonstandardAAs:DerivativefromStandardAAs标准与菲标准氨基酸
8Trivial(common)nameAsparaginefromasparagus(1st,in1806)Glutamatefromwheatgluten(sticky)Tyrosinefromcheese(“tyros”inGreek)StandardAAsThree-letterabbreviationandone-lettersymbol.Theyoftenusethefirstthreeletterandthefirstletter.Whenthereisconfusion,analternativeisused.
9甲硫氨酸甘氨酸丙氨酸缬氨酸亮氨酸异亮氨酸脯氨酸
10苯丙氨酸络氨酸色氨酸FW
11Lambert-Beer’slaw:A=LogIo/I=ecle,extinctioncoefficient;c,concentration;l,opticallength
12丝氨酸苏氨酸半胱氨酸天冬酰胺谷氨酰胺Q
13Cystineisdimerofcysteine
14K赖氨酸精氨酸组氨酸
15D天冬氨酸E谷氨酸
16Naturemayyetsurpriseuswithmoredirectlyencodedaminoacids.Selenocysteine:encodedbytheRNAnucleotidetripletUGAfoundinArchaea,eubacteriaandanimalsincludingmammals.Pyrrolysine:encodedbytheRNAnucleotidetripletUAG,foundinArchaea,andeubacteria. Science(2002)vol.296,1409;1459;1462TworarestandardAAs
17TworarestandardAAs
18incollagen(胶原)incollagen(胶原)inmyosin(肌球蛋白)inprothrombin(凝血酶原)Someincertainproteins(由蛋白质中的某些氨基酸经修饰而成)NonstandardAAs(1)
19鸟氨酸瓜氨酸NonstandardAAs(2)About300incells,butnotinproteins(e.g.ornithine/鸟氨酸,citrulline/瓜氨酸.一般是蛋白质和氨基酸代谢的中间产物)
20§2.1结构特征§2.2种类§2.3主要化学性质§2氨基酸/AminoAcids酸碱滴定曲线特征反应
21氨基酸的酸碱性pKa=2.3pKa=4.8pKa=9.6pKa=10.6
22ApHatwhichanAAhasequalpositiveandnegativecharge---isoelectricpoint(PI).滴定曲线与等电点两个结论:(1)等电点时,氨基酸兼性离子比列达到最大(2)等电点时,氨基酸离子正电荷之和等于负电荷之和
23甘氨酸(类)的滴
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