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天将降大任于斯人也,必先苦其心志,劳其筋骨,饿其体肤,空乏其身,行拂乱其所为。——《孟子》
PCR在HIV感染研究中的应用
前言
简介HIV与PCR技术
主体内容
一、HIV的基因结构
二、PCR在鉴定HIV感染中的意义
三、HIV感染的定量PCR研究
四、PCR的相关问题
五、实例
结语
前言
八十年代以来由人类免疫缺陷病毒HIV(HumanImmunodeficiencyVirus)感染而引起的艾滋
病(AIDS)因其严重的危害性而受到人们高度重视。
图一:HIV图二:HIV
力争早期诊断和寻求有效治疗是防止其广泛传播的关键所在。
聚合酶链式反应(polymerasechainreaction,PCR)
1985年,Mallis等根据核酸自然扩增理论,建立了一种人工体外DNA扩增技术,即聚合酶链
式反应,并于1987年完成了自动化操作,极大地推动了分子生物学的发展,也为包括病毒感染
在内的临床疾病诊断提供了一种崭新的手段。
1、PCR的基本原理
天将降大任于斯人也,必先苦其心志,劳其筋骨,饿其体肤,空乏其身,行拂乱其所为。——《孟子》
靶DNA分子变性后解链,两条单链DNA分别经复性与两条引物互补结合,在4种dNTP存
在和合适的条件下,由DNA聚合酶催化引物由5’-3’扩增延长,每经过变性、复性、延伸一
个循环,模板DNA增加1倍,新合成的DNA链又可作为下一个循环的模板,经过30~50个循
环,可使原DNA量增加106~109倍。
2、主要步骤
PCR的每一循环包括变性、复性、延伸3个步骤,此外整个试验应包括DNA模板提取,如
果模板为RNA,还需增加从RNA到DNA的逆转录过程。除模板提取外,这些操作均可在同一
系统中完成,仅仅改变反应温度即可完成。
3、引物的设计
4、常用的PCR技术(定量PCR等)
5、PCR产物的分析(凝胶电泳等方法)
PCR具有敏感、特异和快速的特点,是检测艾滋病病毒、评价病情进展和探讨发病机理的有
效工具。
本文将就目前HIV与PCR研究的现状,谈谈PCR技术在HIV研究中的应用。
一、HIV的基因结构
HIV的基因结构与其它逆转录病毒基本相同,为RNA双分子,其单链RNA分子由9749个核
苷酸组成,有3组共9个基因。
HIV的模式图
第一组为逆转录病毒共同的基因:gag、pol、env基因,及侧翼的长末端重复顺序(LTR)
等。第二组为调节基因表达的基因:tat、rev、nef。第三组为特有基因:vif、vpu、vpr
天将降大任于斯人也,必先苦其心志,劳其筋骨,饿其体肤,空乏其身,行拂乱其所为。——《孟子》
HIV基因组的蛋白产物
HIV有十分高的遗传变异率,是一个多态性病毒。高度变异区在env基因内,相当于gp120
的五个区段,gag和pol基因较少变异。目前已知HIV有两个型:HIV-1和HIV
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