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最长公共子序列.pptVIP

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最长公共子序列:应用:打字比赛〔规那么,中外区别〕SARS病毒文件比较等等两个一维事物的比较定义:与子串的区别算法:穷举法,动态规划法代码实现:用C

假设给定序列X={x1,x2,…,xm},那么另一序列Z={z1,z2,…,zk},是X的子序列是指存在一个严格递增下标序列{i1,i2,…,ik}使得对于所有j=1,2,…,k有:zj=xij。例如,序列Z={B,C,D,B}是序列X={A,B,C,B,D,A,B}的子序列,相应的递增下标序列为{2,3,5,7}。而子串那么要求左右两元素在母串中为相邻。给定2个序列X和Y,当另一序列Z既是X的子序列又是Y的子序列时,称Z是序列X和Y的公共子序列。给定2个序列X={x1,x2,…,xm}和Y={y1,y2,…,yn},找出X和Y的最长公共子序列。最长公共子序列的定义:

穷举法:假设要求两个序列X,Y的最长公共子序列,先取得X,Y的所有子序列,并进行一一比较,共有如下不同的组合:共要进行不同的比较:2m+n

最长公共子序列的结构设序列X={x1,x2,…,xm}和Y={y1,y2,…,yn}的最长公共子序列为Z={z1,z2,…,zk},那么(1)假设xm=yn,那么zk=xm=yn,且zk-1是xm-1和yn-1的最长公共子序列。(2)假设xm≠yn且zk≠xm,那么Z是xm-1和Y的最长公共子序列。(3)假设xm≠yn且zk≠yn,那么Z是X和yn-1的最长公共子序列。由此可见,2个序列的最长公共子序列包含了这2个序列的前缀的最长公共子序列。因此,最长公共子序列问题具有最优子结构性质。

子问题的递归结构由最长公共子序列问题的最优子结构性质建立子问题最优值的递归关系。用c[i][j]记录序列和的最长公共子序列的长度。其中,Xi={x1,x2,…,xi};Yj={y1,y2,…,yj}。当i=0或j=0时,空序列是Xi和Yj的最长公共子序列。故此时C[i][j]=0。其它情况下,由最优子结构性质可建立递归关系如下:

计算最长公共子序列的长度由于在所考虑的子问题空间中,总共有θ(mn)个不同的子问题,因此,用动态规划算法自底向上地计算最优值能提高算法的效率。voidLCSLength(charx[],chary[],intm,intn){/*计算最长公共子序列的长度*/intL[m][n],i,j;for(i=0;i=m;i++)L[i][0]=0;for(i=0;i=n;i++)L[0][i]=0;for(i=1;i=m;i++)for(j=1;j=n;j++){if(x[i]==y[j])L[i][j]=L[i-1][j-1]+1;elseif(L[i-1][j]=L[i][j-1])L[i][j]=L[i-1][j];elseL[i][j]=L[i][j-1];returnL[m][n];}

举例:填充表格ij012345601d2b3c4b5a6d7bbacdbd

从表中找出最长公共子序列的方法:〔1〕从(m,n)到(0,0)〔2〕假设当前格与左边一格相同,那么画“”;假设当前格与上边一格相同,那么画“”;上两者都不符合,从当前格到左上格画“”〔3〕从当前格向箭头方向前进一格,对此格进行〔4〕从(m,n)到(0,0)的不同路径中,“”相对应的格的元素构成最长公共子序列。

找出最长公共子序列ij01234560000000010000111301122225012223370122344bbacdbd〔bcbd,bcdb,badb〕

求最长公共子序列voidLCS(chara[],intL[][],intm,intn){/*求最长公共子序列*/inti,j,k;charc[m];i=m;j=n;k=m;do{if(L[i][j]==L[i-1][j])i--;elseif(L[i][j]==L[i]j-1])j--

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