网站大量收购独家精品文档,联系QQ:2885784924

玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发.pdf

玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发.pdf

  1. 1、本文档共9页,可阅读全部内容。
  2. 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多

江苏农业学报(Jiangsu/o/Agr.Sci.),2016,32(6):1223〜1231

http://www.jsnyxb.com1223

周玲,梁帅强,林峰,等.玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发[J].江苏农业学报,2016,32(6):1223-1231.

doi10.3969/j.issn.1000^440.2016.06.005:

玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发

周玲,梁帅强,林峰,吕远大

(江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室,江苏南京210014

摘要:随着下一代测序技术(Nextgenerationsequencing,NGS的发展,可以利用咼通量测序数据挖掘基因组特

异的插人/缺失(InDel位点,这使InDel分子标记的开发成为可能。本研究利用327份玉米自交系的测序数据,通过

全基因组结构变异评估发现分布于10条染色体上的25847个InDel位点。利用PIC值逸0.30的3304个位点进行系

统发育树构建和群体结构分析,其结果与利用SNP位点分析获得的结果高度一致,说明这些多态性较高的InDel位点

可以作为代表性标记用于玉米遗传组成的差异分析。采用53对PCR引物进行扩增试验,发现这些InDel引物具有位

点专化特征并且其杂交种鉴定的平均杂合率为0.5692,表明这些标记能准确鉴定出玉米杂交种的杂合度。

关键词:玉米;二态性InDel位点;系统发育树;群体结构

中图分类号:S513.3文献标识码:A文章编号:1000鄄4440(2016)06-1223-09

BiaUelicInDellocidetectionandmolecularmarkerdevelopmentinmaize

ZHOULing,LIANShuai-qiang,LINFeng,LUYuan-da

(Instituteo/Agro-biotechnology/ProvincialKeyLabo/Agro-biology,JiangsuAcademyo/AgriculturalSciences,Nanjing210014,China

Abstract:Nextgenerationsequencing(NGStechnologyrevolutionizedthethroughputofsequencedatageneration

andenabledgenome-wideidentificationofinsertionanddeletionvariation(InDel),whichcouldprovidepotentialinforma­

tionformolecularmarkerdevelopment.However,largescalecharacterizationofInDelinmaizegenomewaspoorlyunder­

stood.Here,weevaluated327maizeinbreedlinesgenomesanddetectedmorethan25847biallelicInDellociacrossten

chromosomes.3304InDellociwithrelativehighP

文档评论(0)

祝星 + 关注
实名认证
内容提供者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档