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ICS65.020.30B41
DB33
浙江省地方标准
DB33/T2254—2020
猪流行性腹泻病毒与猪传染性胃肠炎病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法
MethodofduplexfluorescencequantitativeRT-PCRforthedetectionofporcineepidemicdiazhangchenrrheavirusandtransmissible
gastroenteritisvirus
2020-04-08发布2020-05-08实施
浙江省市场监督管理局发布
DB33/T2254—2020
I
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。
本标准由浙江省农业农村厅提出。
本标准由浙江省畜牧兽医和饲料标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:浙江农林大学。
本标准主要起草人:宋厚辉、邵春艳、王晓杜、孙静、姜胜、周莹珊、杨永春、程昌勇、章先、杨杨、卫芳芳。
DB33/T2254—2020
1
猪流行性腹泻病毒与猪传染性胃肠炎病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法
1范围
本标准规定了猪流行性腹泻病毒(Porcineepidemicdiarrheavirus,PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(Transmissiblegastroenteritisvirus,TGEV)双重荧光定量RT-PCR检测方法的材料准备、样品采集、核酸提取、荧光定量RT-PCR检测及结果判定。
本标准适用于猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒的核酸检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法
3缩略语
下列缩略语适用于本文件。
Ct值:达到阈值的循环数(Cyclethreshold)DEPC:焦磷酸二乙酯(Diethylpyrocarbonate)DNA:脱氧核糖核酸(DeoxyribonucleicAcid)
PBS:磷酸盐缓冲液(PhosphateBufferedSaline)
PEDV:猪流行性腹泻病毒(PorcineEpidemicDiarrheaVirus)RNA:核糖核酸(RibonucleicAcid)
RT-PCR:逆转录聚合酶链式反应(ReverseTranscriptionPolymeraseChainReaction)TGEV:猪传染性胃肠炎病毒(TransmissibleGastroenteritisVirus)
4试剂和材料
4.1除非另有说明,所用试剂均为分析纯;所有试剂均用无RNA酶的容器分装。0.01mol/LPBS和DEPC水配制中所使用的水应符合GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法中一级水的要求。
4.2Trizol:RNA抽提试剂,2℃~8℃保存。
4.3氯仿:2℃~8℃预冷。
4.4异丙醇:2℃~8℃预冷。
4.575%乙醇:用新开启的无水乙醇和DEPC水配制,2℃~8℃预冷。
4.6DEPC水:配置方法见附录A。宜直接购买商品化DEPC处理的无DNA酶和RNA酶的水。
4.70.01mol/LPBS,pH7.2:配制方法见附录A。
DB33/T2254—2020
2
4.82×OneStepRT-PCRbuffer(内含PCRbuffer、dNTPs和Mg2+)。
4.9DNA聚合酶:HSTaqDNA聚合酶(5U/μL)。
4.10反转录酶预混物(内含RNase抑制剂)。
4.11阳性对照:猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎灭活病毒混合物。
4.12阴性对照:DEPC水。
4.13用于RT-PCR反应的引物浓度为10μmol/L,探针浓度10μmol/L,其序列分别为:PEDV上游引物F:5’-GCTTGCTTCGGACCCAGAGG-3’;
PEDV下游引物R:5’-ACGAACAGCCACATTACCACCAA-3’;
PEDV探针P:5’-TTGGAGATGCGGAATTTGTCGAA-3’,其5’端
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