甜瓜PI140471蔓枯病抗性基因定位与转录组学分析.pdfVIP

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摘要I

ABSTRACTIII

绪论VII

第一章文献综述1

1甜瓜蔓枯病研究进展1

1.1甜瓜蔓枯病发病症状与病原菌1

1.2蔓枯病的侵染、传播方式与防治方法1

1.3抗病资源与抗性鉴定标准2

2抗病基因研究进展4

2.1甜瓜蔓枯病抗性遗传分析与基因定位4

2.2葫芦科其他作物抗蔓枯病基因定位研究4

3植物抗病机制研究进展5

3.1植物防御机制5

3.2植物抗病信号转导7

3.3转录组学在植物抗病领域的应用9

第二章甜瓜PI140471蔓枯病抗性基因定位与候选基因分析11

1材料和方法13

1.1试验材料13

1.2材料种植和田间管理13

1.3抗病等级鉴定13

1.4田间病原菌观察和鉴定14

1.5甜瓜基因组DNA的提取16

1.6抗病基因定位16

1.7候选基因在抗、感亲本间的qRT-PCR分析18

2结果与分析20

2.1病原菌形态和分子生物学鉴定20

2.2F2群体抗性鉴定与蔓枯病抗性基因初定位22

2.3区间Indel标记开发与抗病基因精细定位25

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甜瓜PI140471蔓枯病抗性基因定位与转录组学分析

2.4候选基因预测25

2.5候选基因的表达模式分析28

3讨论29

3.1不同抗病性鉴定方法的比较29

3.2甜瓜蔓枯病抗性基因定位30

3.3抗蔓枯病候选基因分析30

第三章甜瓜抗蔓枯病转录组学分析33

1材料和方法35

1.1试验材料35

1.2蔓枯病菌分生孢子悬浮液的配制和接种35

1.3RNA提取、文库构建及测序35

1.4数据过滤及序列组装比对35

1.5差异表达基因的鉴定和总体分析36

1.6qRT-PCR验证RNA-Seq36

1.7接种后甜瓜叶片生理指标测定37

2结果与分析37

2.1抗感材料响应蔓枯病菌侵染的差异37

2.2转录组测序数据分析38

2.3qRT-PCR验证转录组数据40

2.4差异表达基因的鉴定与功能分析40

2.5接种后甜瓜叶片抗氧化相关生理指标变化51

3讨论52

3.1抗感病材料响应蔓枯病菌侵染的对比分析52

3.2可能存在的抗性机制分析53

3.3PI140471中可能存在的蔓枯病防御分子调控网络图54

全文结论57

本论文创新点59

工作展望61

参考文献63

附录73

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目录

攻读硕士期间发表的论文79

致谢81

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摘要

甜瓜PI140471蔓枯病抗性基因定位与转录组学分析

摘要

甜瓜（CucumismeloL.）是葫芦科甜瓜属重要的