垂体神经内分泌肿瘤多组学研究.pdf

摘要

垂体神经内分泌肿瘤(PitNET)是颅内常见的第二大肿瘤，PitNET起源于垂体前叶

(APG)，主要是激素紊乱引起肿瘤发生：泌乳素(PRL)、卵泡刺激素(FSH)和黄体生成素

(LH)、生长激素(GH)、促甲状腺激素(TSH)、促肾上腺皮质激素(ACTH)。激素异常伴随

多种临床症状发生，包括甲亢、肢端肥大症、库欣综合症等，影响机体正常功能，使患

者生活质量下降。随着技术的发展，PitNET检出率上升，人们对于该病的发病机制以

及治疗方法越来越关注。

目前组织学的诊断是PitNET临床亚型分类以及临床治疗的基础。最新的研究表明，

其他脑部肿瘤可以通过基因组学、转录组学和蛋白质组学将疾病划分为不同的分子亚型

[1]，给予不同的治疗措施。多组学分析与临床信息结合，在转录组和蛋白质组水平对

PitNET进行分类，可以增加对疾病的认知，并提出新的靶点和治疗措施。但是目前关

于PitNET的研究仍然局限于基因组水平，不利于分子水平研究和治疗。

为了加大对PitNET的认知，本次研究共纳入200例肿瘤样本和7例对照，涉及10

种常见的临床亚型(GH型、TSH型、PRL型、多激素型、silentPIT1型、ACTH型、silent

TPIT型、GN型、silentSF1型和NULL型)和4种转录因子谱系(SF1、POU1F1、TBX19)。

在这项研究中，对200个肿瘤样本和配对的外周血单核细胞(PBMCs)进行了全基因组检

测，以确定肿瘤基因组中可能存在的基因变异。对194例肿瘤和7个对照样本进行了转

录组测序(RNA-seq)。基于质谱(MS)的无标签定量(LFQ)方法用来描述200例肿瘤和7例

对照的蛋白质组的特征。采用基于Fe-NTA的富集方法，对194例肿瘤和7例对照进行

了磷酸化蛋白组学分析。

首先基于基因组数据，检测与PitNET功能相关的驱动基因，包括高频明星突变USP8

和GNAS。此外研究发现部分基因在CNV-mRNA、CNV-蛋白以及mRNA-蛋白之间具有

一定的关联。接着根据转录组和蛋白质组数据结合临床信息将PitNET划分为5种转录

组亚型和7种蛋白质组亚型。蛋白质组亚型与临床侵袭指标、临床亚型和转录因子谱系

有明显关联，证明了基于分子水平的多组学分型的科学性。其中在转录组分型中发现了

PIT1谱系分为EMT_RNA亚型和Hormone亚型。进一步分析发现，EMT_RNA亚型富

集大量与上皮-间质转化信号通路相关的转录因子，并与肿瘤侵袭相关。我们基于IHC

染色分别在200例PitNET和750例的验证队列中评估组织样本中上皮-间质转化信号通

I

路相关的分子表达。

本研究对PitNET的免疫微环境进行探索，根据转录组数据进行免疫细胞打分和免

疫浸润评估。通过筛选基于35种免疫细胞的打分，通过一致性聚类将垂体瘤分为：耗

竭型、CD4+细胞浸润型、基质型和CD8+细胞浸润型。研究发现不同的免疫亚型呈现特

异的免疫微环境，耗竭型中PDL1分子在mRNA水平显著高表达。随着进一步分析发现，

PITI谱系呈现两种不同的免疫情况，由AK1-STAT1-PDL1轴的改变引起的免疫耗竭和

由JAK3-STAT6-FOS/JUN引起的免疫浸润。为了增加研究的可靠性，我们分别在200

例PitNET和750例的验证队列中根据IHC染色评估组织样本中PDL1的表达。

综上所述，本次研究从基因组、转录组、蛋白质组和磷酸化水平对200例PitNET

进行分析，构建蛋白基因图谱。从转录分型、蛋白分型和免疫分型重新定义PitNET亚

型，并提出相对性的药物靶点，促进对PitNET的研究。

关键词:垂体神经内分泌肿瘤，多组学，上皮-间质转化，免疫微环境

II

ABSTRACT

Pituitaryneuroendocrinetumor(PitNET)isoneofthemostcommonintracranialtumors.PitNET

originatesfromtheanteriorpituitarygland(APG)andismainlycaused