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BMSC来源外泌体介导环状RNA减轻阿霉素导致的心脏毒性

摘要

目的：

探索可能来源于骨髓间充质干细胞外泌体（bonemarrowmesenchymalstem

cell-derivedexosomes,BMSC-Exos）、具有减轻DOX毒性作用的环状RNA

（circularRNA,circRNA）。

方法：

（1）首先将心肌细胞与DOX共培养，DOX损伤的心肌细胞组定义为DOX

组，然后将DOX损伤的心肌细胞与BMSC-Exos共培养，与BMSC-Exos共培养

（BMSC-Exosco-cultured）后的心肌细胞组定义为BEC组；（2）我们分别提取

DOX组和BEC组心肌细胞内的RNA，并将提取的两组RNA进行高通量测序及

circRNA转录组分析；（3）使用相关软件对两组心肌细胞内circRNA进行质量控

制，包括对细胞内的circRNA进行预测、分类、保守性评分和表达量分析；（4）

选择差异倍数（FoldChange,FC）＞2且P＜0.05作为差异性表达有意义的筛选标

准，使用DESeq2软件进行生物重复实验的差异表达分析；（5）运用Targetscan和

mirandacircRNA6

数据库对差异性表达的的靶基因进行预测；（）将预测的靶基因

Geneontology,GO3

通过基因本体论（）在生物学过程、细胞成分和分子功能个方

KyotoEncyclopediaofGenes

面进行富集分析，通过京都基因和基因组百科全书（

andGenomes,KEGG7GOKEGG

）进行通路富集分析；（）结合和富集结果，对

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可能发挥关键作用的细胞生物学途径进行可视化展示；（）应用实时荧光定量聚

合酶链式反应（qRT-PCR）方法对测序结果中BEC组相较DOX组心肌细胞内表达

上调最明显的前5位circRNA进行验证。

结果：

（1）两组心肌细胞中共预测到784个circRNA，414个为已知circRNA，370

circRNAcircRNAexoniccircRNA

个为新发现，其中外显子（）在所有预测到的

circRNA2BECDOX31

种类中占比最高；（）组和组心肌细胞共有个差异表达的

circRNABECDOX22circRNA3GO

，其中组相较组心肌细胞有个表达上调；（）

结果显示：两组心肌细胞中差异性表达circRNA的靶基因主要富集在细胞内信号转

导、RNA生物合成过程调控、核酸模板转录调控、大分子生物合成过程调控和

RNA代谢过程调控等途径；（4）KEGG结果显示：差异性表达circRNA靶基因主

要参与自噬通路、NOD样受体信号通路、各类N-聚糖的生物合成、上皮细胞的细

菌侵袭、泛素介导的蛋白水解和紧密连接途径；（5）综合GO和KEGG富集结

果，我们发现N-多糖生物合成通路、PPAR信号通路、紧密连接信号通路、NOD

I

样受体信号通路在B