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职业教育医学生物技术专业教学资源库人体噬菌体组的影响因素人体菌体组
人体噬菌体组的影响因素一、影响人体微生物组的因素这些因素可以分为3类：①微生物群自身演替规律及群体内部相互作用；②个体年龄、性别、疾病状态等内因；③个体所处地域环境、医疗条件，自身饮食习性、运动等外因。
人体噬菌体组的影响因素二、饮食和抗生素最受关注的影响噬菌体组的因素为饮食和抗生素的使用。抗生素的使用能够显著地影响肠道细菌组及噬菌体组结构，导致噬菌体编码的耐药基因扩增。在给予不同个体相同的饮食之后，个体间的噬菌体组差异相对于饮食之前要小。饮食中果糖和微生物群通过乙酸激酶A介导的乙酸生物合成途径，触发诱导前噬菌体的压力反应，使更多的前噬菌体被释放，胞外检测到的噬菌体丰度增高。
人体噬菌体组的影响因素三、噬菌体组的演替（一）婴幼儿新生儿体内不存在细菌和噬菌体，但出生后的婴儿肠道会迅速被各种微生物定植，初始定植的细菌丰度较低，但噬菌体的丰度和多样性却比较高。新生儿从母体或环境中获得初始菌群，新定植菌群的前噬菌体诱导产生的噬菌体组成为其最初的噬菌体群，随着新生儿暴露于环境及食物的摄取，菌群与噬菌体群得以迅速丰富。新生儿出生后4天内噬菌体组的丰度最高，随后的2～3年，细菌的丰度和多样性开始增高，从以乳酸菌为主转变为接近成人的菌群多样化组成，同时噬菌体的丰度逐渐降低。
人体噬菌体组的影响因素三、噬菌体组的演替（一）婴幼儿从婴儿微生物组到成人化微生物组转变的过程中，人体的肠道微生物群经历了反向的竞争生态模型Lotka-Volterra动力学变化：新生儿肠道内低丰度的细菌不能够满足高丰度的噬菌体的生存需求，导致噬菌体多样性和捕食者压力骤然下降，作为被捕食对象的细菌群丰度开始增高，又进一步影响噬菌体组的丰度。在出生后个体发育的前两年半时间内，婴儿肠道内有尾噬菌体目和微小噬菌体科丰度变化完全相反，前者逐渐降低，而后者逐渐增高。
人体噬菌体组的影响因素三、噬菌体组的演替（二）成年期在成年期，肠道噬菌体组结构呈现高度稳定状态，在健康成人两年半的受试时间内，约80%的肠道噬菌体组是稳定的。与此同时，健康个体间的噬菌体组差异较大。细菌DNA聚合酶的精准复制，溶原性噬菌体突变率较低；而以单链环状DNA为遗传物质的微小噬菌体科则呈现较高的碱基置换率(每天超过10?个核苷酸)。
人体噬菌体组的影响因素三、噬菌体组的演替（三）差异的来源个体间噬菌体组多样性差异主要来源于两个方面：一是每个个体稳定传代的少部分噬菌体组；二是在长期生存过程中进化出来的新物种。健康成人肠道主要的噬菌体同婴儿相比，除了都具有有尾噬菌体目之外，健康成人还具有微小噬菌体科，但是噬菌体宿主范围减小。健康婴儿肠道噬菌体的宿主主要有拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门的某些细菌，而健康成人只有拟杆菌门与厚壁菌门。?
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