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基于多模态MRI影像组学的胶质瘤MGMT基因甲基化状态研究.pdf

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中文摘要

基于多模态MRI影像组学的胶质瘤MGMT基因甲基化状态研究

摘要

第一部分图像预处理方法对基于影像组学预测胶质瘤MGMT基

因甲基化状态的影响研究

目的:

影像组学分析经常受到设备、站点等的不同带来的干扰,本研究旨

在基于随机森林分类器找到各常规磁共振成像(Magneticresonanceimagi

ng,MRI)序列及各序列联合后最适合的图像处理方法。

方法:

首先,回顾性收集了104例(河北医科大学第二医院数据75例,癌

症影像档案【Thecancerimagingarchive,TCIA】公共数据集29例)经

病理证实为O-6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O-6-methylguanine-DNA

Methyltransferase,MGMT)基因甲基化(56例)与非甲基化(48例)

的胶质瘤患者的T1加权像(T1weightedimaging,T1WI)、T2WI(T2w

eightedimaging,T2WI)、液体衰减反转恢复序列(Fluidattenuatedinver

sionrecovery,FLAIR)、对比增强T1加权像(ContrastenhancedT1weig

htedimaging,CE-T1WI)。然后,由两名医师进行感兴趣区勾画,勾画

范围包括瘤周水肿区、坏死区、实质区。之后对各序列的感兴趣区分别

进行Z-score、Nyúl图像处理,之后再各自分别进行绝对灰度离散化和相

对离散化,绝对离散化以固定灰度大小(Fixbinsize,FBS)为1/32、1/

64、1/128的值进行处理,相对离散化以固定灰度数量(Fixbinnumber,

FBN)为32、64、128的值进行处理。并对各序列处理后的图像分别使

用Pyradiomics包进行特征提取、特征筛选并进行随机森林建模,得到单

序列最佳图像处理方式。再联合多序列进行特征筛选并建模,得到多序

列最佳图像处理方式。最后将最佳处理方式的单序列特征联合,进行特

征筛选并通过随机森林建模。

结果:

在单序列,CE-T1WI序列配合NyúlFBS1/64最佳,训练集及测试

集曲线下面积(Areaundercurve,AUC)值为0.972/0.850;T1WI序列

1

中文摘要

配合Nyúl最佳,训练集及测试集AUC值为0.988/0.870;T2WI序列配

合Z-scoreFBN128最佳,训练集及测试集AUC值为0.948/0.819;

FLAIR序列配合NyúlFBS1/64最佳,训练集及测试集AUC值为

0.987/0.824。在多序列建模时,各序列通用NyúlFBS1/128最佳,训

练集及测试集AUC值为0.943/0.913。

结论:

本研究探讨并得到了基于随机森林的单序列、多序列的最佳图像处

理方式。在多序列中,各序列通用NyúlFBS1/128最佳;在单序列

中,T1WI适合Nyúl,T2WI适合Z-scoreFBN128,FLAIR适合Nyú

lFBS1/64,CE-T1WI适合NyúlFBS1/64。本研究在建立了一个性能良

好的模型的同时,也为后续研究者提供了关于图像处理方面的建议。

关键词:图像预处理,胶质瘤MGMT基因,Z-score,Nyúl

2

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