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ICS65.020.30B22
备案号:40493-2014
DB32
江苏省地方标准DB32/T2607-2013
猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒
与猪A群轮状病毒检测技术
多重RT-PCR法
MethodofaMultiplexReverseTranscription-PCRforDetectionofPorcine
EpidemicDiarrheaVirus,PorcineTransmissibleGastroenteritisVirus
andPorcineGroupARotavirus
2013-12-20发布2014-01-20实施
江苏省质量技术监督局发布
DB32/T2607-2013
前言
为规范猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒与猪轮状病毒分子生物学检测技术,提高猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒与猪轮状病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。
本标准按GB/T1.1—2009《标准化工作导则第1部分:标准的结构和编写》编写。
本标准由江苏省农业科学院提出。
本标准起草单位:江苏省农业科学院。
本标准起草人:郭容利、何孔旺、倪艳秀、俞正玉、茅爱华、李彬、温立斌、王小敏。
1
DB32/T2607-2013
猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒与猪A群轮状病毒检测技术多重RT-PCR法
1范围
本标准规定了猪流行性腹泻,猪传染性胃肠炎与猪A群轮状病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。
本标准适用于猪流行性腹泻、猪传染性胃肠炎与猪A群轮状病毒的RT-PCR检测。
本标准适用于猪流行性腹泻、猪传染性胃肠炎与猪A群轮状病毒实验室诊断、流行病学调查。
2规范性引用文件
下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修订单)适用于本文件。
GB16548—2006病害动物和病害动物产品生物安全处理规程
NY/T541—2002动物疫病实验室检验采样方法
3主要试剂
3.1DNAMarkerDL-2000
3.3TRIzol
3.4DEPC
3.5小量胶回收试剂盒
3.6氯仿
3.7异丙醇
3.8无水乙醇
3.9反转录试剂盒
3.10HSTMMix
4引物
根据GenBank上公布的PEDV核蛋白N基因序列,TGEV糖膜蛋白M基因序列,猪A群轮状病毒(PARV)内衣壳蛋白VP6基因序列,分别在其保守区设计一对特异性引物见表1。
表1引物序列表
引物
引物序列
PCR产物长度bp
退火温度℃
PEDVN1
5’-gcatttctactacctcggaa-3’
750
54
PEDVN2
5’-gcgatctgagcatagcctga-3’
TGEVM1
5’-gcgtctgattgtgagtcatg-3’
544
54
TGEVM2
5’-aatagtcctgctgggtaatg-3’
PRVP61
5’-cagcgtactggattcgtgtt-3’
275
54
PRVP62
5’-tcttgggaaactgaacctct-3’
5样品
2
DB32/T2607-2013
5.1阳性病毒样品的取样
5.1.1PEDVCV777疫苗毒株,VERO细胞培养。
5.1.2TGEVJSXB2010细胞毒,ST细胞培养。
5.1.3PARVNan86细胞毒,Marck145细胞培养。
上述三种病毒按107TCID50/ML等量混合后备用做阳性样品。
上述三种细胞加培养液冻融三次后等量混合后备用做阴性对照。
5.2粪便与组织样品的处理
按照NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法,采集腹泻猪的粪便或肠组织样品,在粪便或研磨好的小肠组织中按1:10加入DEPC水,剧烈震荡使其混和均匀,5000rpm,离心20min,取上清于-20℃备用。反复冻融三次后,以5000rpm,离心20min,取上清。对每个样品进行编号标记。
另外,按照GB16548—2006病害动物和病害动物产品生物安全处理规程处理待检粪便或组织样品。
5.3细胞培养物样品的处理
细胞培养物反复冻融三次后,以12000r
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