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SpeciesDelimitationandHistoricalBiogeographyintheGenusHelice(Brachyura:Varunidae)intheNorthwesternPacificWeiYin,CuizhangFu*,LiGuo,QixinHe,JunLi,BinsongJin,QianhongWuandBoLi西北太平洋厚蟹属的物种界定和生物地理研究报告人:胡志勇指导教师:傅萃长副教授作者介绍12副教授复旦大学主要研究方向:生态与历史生物地理;亲缘动物地理学;鱼类的系统发育与进化;河口的鱼类生态学与渔业通讯作者:傅萃长博士研究生复旦大学研究方向:生物地理学,鱼类进化第一作者:殷维Contents研究背景1目的内容2材料方法3研究结果4讨论5重要名词解释Pliocene:上新世,属于新生代第三纪后期,上新世猿人下树进入平地Pleistocene:更新世,属于新生代第四纪早期,更新世人类开始出现juniorsynonyms:后来命名的同物异名种,一般不被采用analysisofmolecularvariance(AMOVA):分子方差分析指通过估计单倍型(含等位基因)或基因型之间的进化距离,进行遗传变异的等级剖分,巧妙的避开了分子差异不便于计算的难题Haplotyple:是单倍体基因型的简称,在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合研究背景厚蟹属Helice厚蟹隶属于节肢动物门、甲壳纲、十足目、方蟹科厚蟹种类:台湾厚蟹H.formosensis;侧足厚蟹H.latimera;天津厚蟹H.tientsinensis;三齿厚蟹H.Tridens共四种2.厚蟹分布:西北太平洋大陆和岛屿海岸线潮间带的较高区域FrombaiduYinetal.研究背景西北太平洋独特的地理特征1邻接着众多的边缘浅海,有日本海、黄海、东中国海、南中国海2西北太平洋在末次盛冰期时的海岸线(Ota,1998)引自陈卉3上新世和更新世冰期交替4海平面的升降5海面轮廓改变6影响物种的形成7隔离和二次接触8作用过程9研究背景—此前的研究影响近海鱼类种群空间结构(Liuetal.,2006,2007)影响海洋产卵蟹类的物种形成和种群空间结构(Wangetal.,2008)影响潮间带螺类和近海鱼类的系统地理分布(Kojimaetal.,2003,2004,2006;Liuetal.,2008)鱼类蟹类螺类鱼类上新世和更新世冰期交替西北太平洋洋流此前的研究1ShihandSuzuki(2008)分析了厚蟹线粒体16SRNA和COI基因,认为H.latimera,H.formosensis和H.tientsinensis组成了一个有待解决的复合分支H.latimeraclade,由此推测厚蟹可能只由两个种组成H.latimera和H.Tridens2研究背景使用的分子标记少,仅有16SRNA和COI基因形态学没有佐证Shih提出的H.formosensis和H.Tientsinensis是H.latimera同物异名种(他们眼框下的齿堤数有显著差异)研究的地理区域相对较小没有给出明确的种的分界标准ShihandSuzuki的研究存在的不足2341研究背景研究厚蟹属的历史生物地理学,分析厚蟹属的物种形成机制扩大研究的范围使用更多分子标记探究厚蟹属内物种的个数,建立种与种之间的形态学分类标准本研究拟解决的问题研究目的材料方法厚蟹的采集共17个样点共采集123个样本,—42H.formosensis—37H.latimera—42H.tientsinensis—1Helicanawuana—1Chasmagnathusconvexus3241采用酚氯仿法从蟹的腿部肌肉提取总DNA(Palumbi,1996)使用与PCR相同的引物做测序DNA的提取,扩增,测序PCR扩增以下片段:12SrRNA,16SrRNA,COI,ITS-2和28SrRNA5–2.0%的琼脂糖凝胶电泳纯化PCR产物材料方法丢弃前三分之一部分,余下部分用于构建系统树04以每百代取样频率在中运行九百万代(RonquistandHuelsenbeck,2003)0
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