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多聚酶链式反应扩增DNA片段
学问?巧学
一、PCR原理
1.多聚酶链式反应(又称PCR技术)是一种体外快速扩增DNA片段的技术,它能以极少量的DNA为模板,在几小时内复制出上百万份的DNA拷贝。
2.用PCR技术扩增DNA时,DNA的复制过程与细胞内DNA的复制过程类似。
要点提示DNA的两条链是反向平行的。为了明确表示DNA的方向,通常将DNA的羟基末端称为3′端,而磷酸基团的末端称为5′端。DNA聚合酶不能从头起先合成DNA,而只能从引物的3′端延长DNA链。
辨析比较DNA聚合酶和DNA连接酶
(1)DNA聚合酶只能将单个核苷酸加到已有的核酸片段的3′末端的羟基上,形成磷酸二酯键;而DNA连接酶是在两个DNA片段之间形成磷酸二酯键,不是在单个核苷酸与DNA片段之间形成磷酸二酯键。
(2)DNA聚合酶是以一条DNA链为模板,将单个核苷酸通过磷酸二酯键形成一条与模板链互补的DNA链;而DNA连接酶是将DNA双链上的两个缺口同时连接起来。因此DNA连接酶不须要模板。
3.在80~100℃
疑点突破TaqDNA聚合酶是从Thermusaquaticus菌提取的热稳定性酶,分子量大约为94kDa。这种酶的自然形式可在74℃
二、PCR的反应过程
PCR一般要经验三十多次循环,每次循环可以分为变性、复性和延长三步。
1.变性当温度上升到90℃
2.复性温度下降到50℃
3.延长温度上升到72℃
要点提示PCR的反应过程和DNA的复制过程的区分:体外DNA进行、不需解旋酶、条件不同。PCR反应须要在肯定的缓冲溶液中供应:DNA模板、两种引物、四种脱氧核苷酸、耐热的DNA聚合酶,同时通过限制温度使DNA的复制在体外反复进行。
三、试验操作
1.用微量移液器,依据下列配方在微量离心管中依次加入各组分
PCR反应体系的配方
10倍浓缩的扩增缓冲液 5μL
20mmol/L的4种脱氧核苷酸的等量混合液 1μL
20mmol/L的引物Ⅰ 2.5μL
20mmol/L的引物Ⅱ 2.5μL
H2O 28~33μL
1~5U/mL的TaqDNA聚合酶 1~2U
模板DN A5~10μL
总体积 50μL
2.参照下表的设置设计好PCR仪的循环程序
循环数
变性
复性
延长
第1次
94℃
——
——
30次
94℃
55℃
72℃
最终1次
94℃
55℃
72℃
问题?探究
问题1PCR技术怎样扩增DNA?
探究:待扩增DNA模板加热变性后,两引物分别与两条DNA链的两端序列实现特异性复性结合。此时,两引物的3′端相对,5′端相背,扩增的片段由5′端向3′端延长。在适当的pH和离子强度下,由TaqDNA聚合酶催化引物的延长。
上述反应过程是通过温度限制来实现的。热变性—复性—延长的一个周期过程称为一个PCR循环。PCR全过程就是在适当条件下的这种循环的多次重复。首次PCR中延长的产物在进入其次次循环变性后,再与引物互补,充当引导DNA合成的新模板。因此,其次轮循环后,模板由首轮循环后得到的4条增为8条(包括原始模板在内),以此类推,以后每一循环后的模板均比前一循环增加1倍。从理论上讲,扩增DNA产量可呈指数上升,即n个循环后,产量为2n拷贝。
问题2引物的特点是什么?
思路:引物是PCR特异性反应的关键,PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链做引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。
探究:(1)引物长度:15~30bp,常用为20bp左右。
(2)引物扩增跨度:以200~500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。
(3)引物3′端的碱基,特殊是最末及倒数其次个碱基,应严格要求配对,以避开因末端碱基不配对而导致PCR失败。
(4)引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其他序列无明显同源性。
典题?热题
例1关于PCR引物的下列说法,不正确的是()
A.引物是PCR过程中与模板DNA部分序列互补,并能引导模板DNA的互补链合成的(脱氧)核苷酸序列
B.引物常依据须要扩增的目标DNA的碱基序列用化学合成的方法获得
C.DNA聚合酶只能使DNA链从引物的3′端起先向引物的5′端延长
D.引物的3′端必需具有游离的-OH基团
解析:DNA聚合酶只能将单个核苷酸加到已有的核酸片段的3′末端的羟基上,形成磷酸二酯键;延长DNA链是从5′端向3′端延长。
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