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蛋白质模拟与药物设计.ppt

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*BoxandGrid第27页,共62页,星期日,2025年,2月5日*第28页,共62页,星期日,2025年,2月5日*ProbeAtomorGroup

electronicatom,ionormoleculewithcertainvolumeH2OWater,theHydrophobicProbeH+ElectrostaticinteractionCH3StericinteractionC+sp3ElectrostaticStericinteractionO::sp2carboxyoxygenatomN:=sp2NwithlonepairN3+sp3amineNH3cationO-sp2phenolateoxygen第29页,共62页,星期日,2025年,2月5日*BoxandGridpKi=B(D1)+C(D2)++...APLS:第30页,共62页,星期日,2025年,2月5日*StericCoMFAContourMap第31页,共62页,星期日,2025年,2月5日*ElectrostaticCoMFAContourMap第32页,共62页,星期日,2025年,2月5日*Exp.Pred.第33页,共62页,星期日,2025年,2月5日Receptor-baseddrugdesign*生物信息学*分子生物学和结构生物学的发展,使得一些靶标生物大分子的功能被阐明,三维结构被测定计算机科学的发展,出现了功能先进的图形工作站,极大地提高了计算和数据分析的速度和精度;发展了许多药物分子设计方法,如基于生物大分子三维结构的分子对接(MolecularDocking)方法和基于药物小分子的三维定量构效关系分析方法和数据库搜寻方法等。第34页,共62页,星期日,2025年,2月5日*生物信息学*PDBstatistics第35页,共62页,星期日,2025年,2月5日**AAAAAAAAAAAAAA第36页,共62页,星期日,2025年,2月5日FindaLeadCompoundNMRBindingSiteProtein第37页,共62页,星期日,2025年,2月5日ProteinNOOBSERVABLEBIOLOGICALEFFECT第38页,共62页,星期日,2025年,2月5日13CNMRCCCHCHCHCH2CH2CH3CH3第39页,共62页,星期日,2025年,2月5日CH2CH313CNMRCCCHCHCHCH2CH3第40页,共62页,星期日,2025年,2月5日ProteinOptimizeepitope第41页,共62页,星期日,2025年,2月5日ProteinOptimizeepitopeOptimizeepitope第42页,共62页,星期日,2025年,2月5日LEADCOMPOUND第43页,共62页,星期日,2025年,2月5日MeEpitopeAEpitopeB第44页,共62页,星期日,2025年,2月5日生物技术制药——绪论生物信息学生物信息学3D-QSARComputer-AidedQuantitativeStructure-ActivityRelationship关于蛋白质模拟与药物设计第1页,共62页,星期日,2025年,2月5日蛋白质分子模拟与设计蛋白质结构解析方法:X-射线单晶衍射,NMR…*生物信息学*RecombinantSomatostatin生长抑素第2页,共62页,星期日,2025年,2月5日*生物技术制药——绪论*b-interferonb-interferon第3页,共62页,星期日,2025年,2月5日X-射线衍射原理按照确定方式在三维空间严格的周期性规则排列各种原子、分子或离子晶体第4页,共62页,星期日,2025年,2月5日点阵晶胞第5页,共62页,星期日,2025年,2月5日晶胞结构图αβγ晶胞第6页,共62页,星期日,2025年,2月5日X-射线单晶衍射图谱第7页,共62页,星期日,2025年,2月5日X-rayCrystallographyBasicSteps分离表达纯化结晶目标选择数据收集结构解析

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