《猪SINE反转录转座子插入多态（RIP）分子标记遗传多样性检测技术规程》征求意见稿.pdf

ICS65.020.99

CCSB40/49

JAASS

团体标准

T/JAASSXX—2022

猪SINE反转录转座子插入多态（RIP）分子

标记遗传多样性检测技术规程

ProtocolofdetectionforgeneticdiversityofswineSINEretrotransposoninsertion

polymorphism(RIP)

（征求意见稿）

在提交反馈意见时，请将您知道的相关专利连同支持性文件一并附上。

XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施

江苏省农学会  发布

T/JAASSXX—2022

猪SINE反转录转座子插入多态（RIP）分子标记遗传多样性检测技

术规程

1范围

本文件规定了猪SINE反转录转座子插入多态（RIP）分子标记遗传多样性检测技术规程。

本文件适用于猪个体基因分型检测、群体遗传杂合度、等位基因频率、多态信息含量、品种间遗传

距离等分析。

2规范性引用文件

下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，

仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本

文件。

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。

GA/T383法庭科学DNA实验室检验规范

NY/T1673畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程

SN/T1193-2003基因检验实验室技术要求

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1反转录转座子retrotransposon

在基因组中能完成自我复制，以RNA作为中介，在反转录酶的作用下，整合到基因组其他位点中

的功能元件。

3.2反转录转座子插入多态retrotransposoninsertionpolymorphism

因转座作用，反转录转座子插入到基因组不同区域，使插入位点呈2个等位基因的现象。

3.3等位基因频率Allelefrequency

给定座位上某等位基因所占的比例。

3.4遗传杂合度heterozygosity

群体在某个座位为杂合子的比例，用于衡量标记方式的信息含量程度。

3.5平均遗传杂合度averageheterozygosity,H

表示群体平均在各座位为杂合子的比例，用于衡量标记方式的信息含量程度

3.6多态信息含量polymorphisminformationcontent,PIC

表示后代所获得某个等位标记来自于它的父亲（或母亲）的同一个等位标记的可能性。

3.7遗传距离geneticdistance

用基因频率的函数表示的群体间遗传差异，它的最适宜的测度是单位长度DNA的核苷酸数或密码

子的差数。群体或个体间的遗传距离越小，它们之间的亲缘关系越近，反之群体或个体间的遗传距离越

大，那么它们之间的亲缘关系将越远。遗传距离的计算方法有多种有Nei氏标准遗传距离Neisstandard

geneticdistance,D和Nei氏遗传距离Neisgeneticdistance,D。

SA

3.8聚类分析clusteranalysis

用数学方法来具体而形象地描述