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ICSB41
65.020.30
DB37
山东省地方标准DB37/T1827—2011
猪圆环病毒2型荧光PCR检测技术
Real-timePCRAssayfortheDetectionofPorcineCircovirusType2
2011-04-08发布2011-06-01实施
山东省质量技术监督局发布
I
DB37/TXXXX—XXXX
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本标准的附录A为规范性附录。
本标准由山东省农业科学院提出。
本标准由山东省畜牧业专业标准化技术委员会归口。
本标准主要起草单位:山东省农业科学院畜牧兽医研究所。
本标准主要起草人:王金宝、李俊、吴家强、时建立、吴晓燕、丛晓燕、孙文博、杜以军。
1
DB37/TXXXX—XXXX
猪圆环病毒2型荧光PCR检测技术
1范围
本标准规定了猪圆环病毒2型(PCV2)荧光PCR检测技术的要求。本标准适用于猪血清和组织中猪圆环病毒2型的检测。
2材料
2.1器材
2.1.1微量移液器(最大量程为10μL、20μL、100μL、1000μL)
2.1.220000g高速冷冻离心机
2.1.3紫外分光光度计
2.1.4PCR仪
2.2荧光定量PCR仪试剂2.2.1质粒提取试剂盒
2.2.2SYBRGreenⅠ核酸染料
2.2.3凝胶回收试剂盒
2.2.4蛋白酶K(见附录A.1章)
2.2.510%SDS液(见附录A.2章)
2.2.670%乙醇(见附录A.3章)
2.2.71%琼脂糖凝胶(见附录A.4章)
2.2.8DNAMarker20002.3引物
Y1:5’-GCTGATTTCTTTTGTTGTTTGGTT-3’Y2:5’-GAGTGGGCTCCAGTGCTGTTAT-3’
3方法
3.1质粒标准阳性模板的制备3.1.1质粒的构建及鉴定
利用普通PCR技术扩增出PCV2的ORF2基因702bp片段,凝胶回收后克隆到克隆载体。纯化质粒,并转化DH5α感受态细胞,挑选转化长出的菌落进行培养,提取质粒进行PCR鉴定。
3.1.2重组质粒浓度的测定
将阳性重组质粒作20倍稀释,用紫外分光光度计测定其浓度,并计算标准品的拷贝数。3.1.3标准品制备
将重组质粒稀释至1.0×1010拷贝/μL后再倍比稀释,分别以109、108、107、106、105拷贝/μL5个梯度作为标准品模板,-70℃保存备用。
2
DB37/TXXXX—XXXX
3.2病毒基因组的提取
对病料用蛋白酶K裂解法提取总DNA。
3.2.1病料处理:取小块病料组织于研钵中,用剪刀剪碎,加入2mLPBS缓冲液,研磨。
3.2.2取研磨液500μL于1.5mL离心管中,加入50μg/mL的蛋白酶K5μL,加入10%的SDS溶液25μL,55℃水浴2-3h。
3.2.3加入200μLTris饱和酚,充分混匀,10000g离心15min。
3.2.4取上清于一新的离心管中,加入200μLTris饱和酚和200μL氯仿,10000g离心15min。3.2.5取上清于一新离心管中,加入200μL氯仿,10000g离心15min。
3.2.6取上清于一新离心管中,加入2倍体积的无水乙醇,-20℃静止20min,10000g离心15min,弃上清。
3.2.7加入70%的乙醇冲洗沉淀表面及管壁,弃乙醇,晾干。3.2.8加入100μL灭菌超纯水溶解沉淀,-20℃保存备用。
3.3荧光定量PCR体系,详见表1。
表1荧光定量PCR反应体系
步骤1
SYBRGreenⅠ核酸染料
12.5μL
步骤2
引物Y1
1.0μL
步骤3
引物Y2
1.0μL
步骤4
DNA
2.0μL
步骤5
超纯水
8.5μL
总量
25.0μL
荧光定量PCR程序设定
每次PCR均应设一个阴性对照,具体参数见表2。
表2荧光定量PCR反应程序设定
温度
时间
步骤1
95℃
3min
步骤2
95℃
10s
59℃收集信号
10s
步骤3
95℃
2min
60℃
20s
95℃
Continue
4结果判定
读取检测结果。阈值设定原则以阈值线刚好超过正常阴性对照品扩增曲线的最高点。
4.1
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