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基于COI序列的哈蟆油基原动物DNA条形码鉴定研究
哈蟆油具有较高的经济和社会价值,其混伪品较多,给市场造成了很大的
混乱。利用基于COI序列的DNA条形码技术对已鉴定的东北林蛙、中国林蛙、
桓仁林蛙和黑龙江林蛙进行PCR扩增和测序,建立4种林蛙COI基因数据库;
将所测的序列与GenBank上的序列进行比对,显示为上述4种林蛙;应用MEGA
(molecularevolutionarygeneticsanalysis)7.0软件计算K2P遗传距离并构建NJ
(neighbor-joining)系统聚类树,所测4种林蛙的序列和GenBank上下载的4种
林蛙的序列分别聚为1支,但与GenBank上下载的2个外群独立分开,东北林
蛙的COI基因可能存在地域性差异,但该技术并不能鉴别林蛙的雌雄。结果显
示DNA条形码技术能够准确鉴定哈蟆油的基原动物,说明DNA条形码COI为
哈蟆油基原动物的鉴定提供一个新的手段和方法。
标签:哈蟆油;东北林蛙;中国林蛙;DNA条形码;鉴定
IdentificationofRanaeOviductusoriginalanimalbasedonCOIsequences
WANGMeng-hu,KANGTing-guo*,XULiang*,YANGYan-yun,CAI
Zhen-jiao
(LiaoningUniversityofTraditionalChineseMedicine,Dalian116600,China)
[Abstract]RanaeOviductushasahigheconomicandsocialvalue,butits
adulterantsaremorenumerous,whichcausesagreatconfusiontothemarket.Using
DNAbarcodetechnologybasedonCOIsequenceforPCRamplificationand
sequencingoftheidentifiedRanadybowskii,R.chensinensis,R.huanrensisandR.
amurensiss,theCOIgenedatabaseoffourspeciesofRanawasestablished,and
comparingthemeasuredsequencewiththesequenceofGenBank,fourkindsof
Ranawereidentified.TheMEGA(molecularevolutionarygeneticsanalysis)7.0
softwarewasusedtocalculatethegeneticdistanceofK2PandconstructtheNJ
(neighbor-joining)systemclustertree.ThesequenceofthefourspeciesofRana
measuredwereclusteredintoonegroupwiththesequenceofthefourkindsofRana
downloadedfromGenBank,butseparatedfromthetwooutergroupsdownloaded
fromGenBank.TheCOIgeneoftheR.dybowskiiwaslikelytohaveregional
differences,howeverthistechniquefailedtodistinguishmaleandfemaleRana.The
resultsshowedthatDNAbarcodetechnologycouldaccuratelyidentifythebaseof
originalanimalofR.oviductus.ItindicatesthatDNAbarcodeCOIpro
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