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基因组和染色体.pptVIP

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七.遺傳學作圖的分子標記1.簡單序列長度多態性(simplesequencelengthpolimorphismSSRPs),短的串聯重複多態性(shorttandemrepeatspolimorphismSTRPs),同向重複序列可變數(variablenumberoftandemrepeatsVNTR)限制性片斷長度或PCR產物長度因小衛星和微衛星隨機重複數量的變化而形成的差異。小衛星DNA主要存在於端粒區,因此不是理想的基因組分析材料。微衛星分佈於整個基因組中,是常用的材料。2.隨機PCR(randomamplified

polymorphicDNA,RAPD)以短片斷(10nt)隨機引物擴增DNA,其PCR產物大小不同,經電泳可顯示出“條碼”,RAPD可用來鑒別個體,常規遺傳學分析,群體遺傳的研究。多用於植物基因組作圖。四Alu家族長約300bp;Alu順序也稱為短的分散因數(shortinterspersedelements,SINEs)。由RNA多聚酶III轉錄的。在基因組中30萬個拷貝;在170bp處有一AluI的酶切位點;由兩個130bp的串聯重複順序組成;在二聚體的右半部有31bp插入序列,此插入順序來自7SLRNA。Alu順序有何應用價值?AluI30bpAlu序列五.高度重複順序衛星DNA(satelliteDNA)隱蔽衛星DNA(crypticsatellite)自私DNA(selfishDNA)伊甸園DNA(GardenofEdenDNA)小衛星(minisatellite)重複序列可變數(variablenumbertandemrepeatVNTRs)DNA指紋(DNAfingerprints)小衛星(minisatellite)或同向重複序列可變數(variablenumbertandemrepeat,VNTRs)。這是一種特殊的串聯重複,多存在於染色體的端粒附近,在不同個體和基因組的不同位點上數目都不同。在人類中VNTRs位點是1-5kb的序列,此序列由單位長15-100nt的重複序列組成。微衛星DNA(microsatelliteDNA)另一類分散的重複DNA是1~4核苷酸重複序列構成的15~100個重複單位,這一類重複DNA稱為微衛星DNA(microsatelliteDNA),也稱為簡單序列的重複(simplesequencerepeats,SSRs)。雖然一般不包括VNTR,但微衛星實際上是由可變數目的2~4核苷酸重複序列組成的。在人類和其他生物的基因組作圖中,這種類型的重複序列可提供密集排列的分子標記。人類VNTRs的第一個探針1985年由AlecJeffries製備在肌紅蛋白基因的第一個內含子中分離出132bp的重複順序內含4個長33bp的重複單位內有13bp為核心順序(GGAGGTGGGCAGG)L1家族長6500bp左右稱為長的分散因數(longinterspersedelements,LINEs)在基因組中約6萬個拷貝由RNA多聚酶II轉錄的。屬於一種轉座因數基因簇(genecluster)基因家族(genefamily)假基因(pseudogene)加工假基因(processedpseudogenes)。有以下的特點:⑴缺少正常的內含子;⑵3’末端有多聚腺苷酸;⑶5’端的結構和mRNA的5’端十分相似;⑷兩側有順向重複順序的存在。對以上特點作何推論?因此人們推測它似乎和mRNA一樣經過了轉錄後加工,因此也稱其為加工假基因;第六節 C-值矛盾C值矛盾(C-valueparadox)可能產生的原因是什麽?第七節???????斷裂基因間隔順序(spacer)間插順序(interveningsequence)內含子(intron)等一???內含子的發現1977[美]SharpRoberts同時發現了斷裂基因(splitgene)[

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