蛋白质组学课件.ppt

*相互作用組的研究可以分為兩類一類是研究蛋白質相互作用的網路，細胞內的許多活動如信號轉導等都是通過一個複雜而廣泛的蛋白質相互作用網路來實現的；另一類是研究蛋白質複合體的組成,蛋白質複合體通常可以分為2種，一種是結構型蛋白質複合體，如核孔複合體，通常比較穩定；另一種則是功能型蛋白質複合體，如負責轉錄的轉錄蛋白複合體和負責DNA複製的複製蛋白複合體，這類複合體只有在執行功能時才聚合在一起，很不穩定。相互作用組（interactome）*對一個基因組表達的全部蛋白質進行鑒定和精確定量的科學。細胞內各種蛋白質的豐度並不單單在轉錄水準上被調控，還在翻譯水準和翻譯後修飾的水準被調控，因而不能通過檢測體內的mRNA的豐度來間接進行準確的蛋白質定量。DifferentialstainingIsotopecodedaffinitytags(ICAT)定量蛋白質組學（quantitativeproteomics）直接對蛋白質定量*各類蛋白質樣品製備技術蛋白質分離技術蛋白質鑒定技術蛋白質組研究的定量方法蛋白質組研究技術概述蛋白質組學的產生蛋白質組的研究方法蛋白質組研究的內容WhyHowWhatUse蛋白質組學在生物醫學研究中的應用*各類蛋白質樣品製備技術蛋白質分離技術蛋白質鑒定技術蛋白質組研究的定量方法蛋白質組研究技術概述How?從細胞/組織/體液等進行蛋白樣品全息製備對混合蛋白樣品獲得最佳分離效果——電泳、色譜對分離的蛋白進行鑒定——圖像分析技術、質譜技術(鑒定原理）對分離的蛋白進行定量鑒定——蛋白質組學研究的關鍵技術及面臨的技術挑戰*蛋白質組研究技術概述蛋白質的表達水準、翻譯後修飾及其相互作用雙向凝膠電泳-質譜多維色譜-質譜磷酸化蛋白質組學糖蛋白質組學生物化學方法遺傳學方法生物資訊學方法表達蛋白質組學功能蛋白質組學定量蛋白質組學*各類蛋白質樣品製備技術蛋白質分離技術蛋白質鑒定技術蛋白質組研究的定量方法蛋白質組研究技術概述蛋白質組學的產生蛋白質組學的研究方法蛋白質組學研究的內容WhyHowWhatUSE血漿蛋白質組學癌蛋白質組學修飾蛋白質組學定量蛋白質組學結構蛋白質組學功能蛋白質組學亞細胞蛋白質組學藥物蛋白質組學毒理蛋白質組學蛋白質組學在生物醫學研究中的應用*蛋白質組學*蛋白質組學的產生蛋白質組的研究方法蛋白質組研究的內容WhyHowWhatUsewhyproteins?why–omics?蛋白質組學在生物醫學研究中的應用*Why?WejustknowtheINFORMATION.2004年，國際人類基因組組織正式宣佈人類基因組計畫完滿結束，辨認了大約3.2萬個基因（32億個堿基對）。除了已經知道有蛋白質產物的基因以外，其餘的基因只是計算出的可讀框（OpenReadingFrame）基因組的ORF準確數目確定困難ORF是否與蛋白質有一一對應關係也不能肯定擬基因pseudogene、RNA編輯、蛋白質剪切*Why?基因功能的注釋依賴於對蛋白質的認識WemustknowthePROTEINS.蛋白質存在形式和活動規律依賴於直接對蛋白質的研究蛋白質是生命的組成者和生命活動的執行者*Assumption如果把人類252種細胞中的蛋白質全部鑒定出來則可以真正知道人類基因組的所有基因。*Why?生命現象涉及到多個蛋白質，多個蛋白質的參與是交織成網路的，在執行生理功能時蛋白質的表現為多樣和動態。生物學研究的最終目標是瞭解生物系統的所有組分和運行機制及系統水準的協同行為.蛋白質所表達功能只有在同一細胞內其他蛋白質的功能和活性同時表達才有意義.*氨基酸數量多於核苷酸蛋白結構複雜、多樣複雜的修飾方式蛋白質數量難以估計沒有類似於PCR和分子雜交的技術蛋白質研究的難度大於DNA研究從DNA到蛋白質：複雜性增加、 高度動態、 彼此作用，由此更增加了研究難度considerthecellasacollectionofPROTEINMACHINES*Why?Whatanawfulnumber!*TheWorldofOmicsGENOMICSMETABONOMICSTRANSCR