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ICS11.020
C62
DB22
备案号:35806-2013
吉林省地
方
标
准
DB22/T1673—2012
莱姆病螺旋体的检测荧光PCR法
DetectionofBorreliaburgdorfe——FluorescencePCR
吉林省质量技术监督局
发布
DB22/T1673—2012
前
言
本标准依据GB/T1.1-2009、GB/T20001.4-2001给出的规则起草。
本标准由吉林出入境检验检疫局提出并归口。
本标准起草单位:吉林出入境检验检疫局检验检疫技术中心。
本标准主要起草人:刘阳、王玮琳、丁旭、孙舒、刘韬、刘金华、牛茜、罗雁非、郑旭。
I
DB22/T1673—2012
莱姆病螺旋体的检测荧光PCR法
警告——为了保护实验室人员的安全,应由具备资格的工作人员进行检测。培养物和废物应小心处
置,并按GB/T19489中的有关规定执行。
1范围
本标准规定了莱姆病螺旋体荧光PCR检测方法
本标准适用于莱姆病螺旋体的实验室检测。
2规范性引用文件
下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的
版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和实验方法
GB/T19489实验室生物安全通用要求
3缩略语
Tm值:核酸融解温度(Meltingtempreture)。
实时荧光PCR方法,是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累,实时监测整个PCR进程,
最后通过荧光信号的增幅情况来判定反应结果。PCR反应体系中加入一对引物的同时加入一条特异性荧
光探针,探针两端分别标记荧光报告基团和荧光淬灭基团,PCR扩增时,利用Taq酶的水解作用,使探针
上的荧光报告基团远离淬灭基团而发出荧光信号,荧光检测系统可接收到荧光信号,此方法检测的是积
累荧光。MGB探针(Minorgroovebinderoligodeoxynucleotideconjugate,MGB-ODN),5′端标记FAM
荧光素为报告基团,3′端采用了非荧光性的淬灭基团,吸收报告基团的能量后并不发光,降低了本底
信号的干扰。此外,MGB探针的3′端还连接了一个二氢环化吲哚卟啉-三肽(Dehydrocyclopyrroindole
tripetide,DPI3),可以稳定探针与模板的杂交,升高探针Tm值,使较短的探针同样能达到较高的Tm
值。
1
DB22/T1673—2012
5试剂与材料
除另有说明以外,所用试剂均为分析纯或生化试剂,所用水为符合GB/T6682中规定的二级水。
5.1试剂配制
见附录A。
5.2引物及探针
上游引物:5′–GCTGTAAACGATGCACACTTGGT-3′
下游引物:5′-GGCGGCACACTTAACACGTTAG-3′
探针:6-FAM-TTCGGTACTAACTTTTAGTTAA-MGBNFQ
5.3质控品
空白对照:以水代替DNA模板。
阴性对照:非目标菌的DNA作为荧光PCR反应的模板。
阳性对照:莱姆病螺旋体标准株ATCC35210DNA作为荧光PCR反应的模板。
6仪器设备
取单只活蜱,用70%乙醇浸泡,生理盐水清洗3次,滤纸吸干后。将单只蜱放入1.5mL离心管中,加入
500μLTE缓冲液,用匀浆仪研碎。匀浆液10000r/min,离心2min,弃上清,沉淀备用。
500μLEDTA抗凝血液中加入1mL无菌水,5000r/min,离心2min,弃上清,沉淀备用。新鲜血样
品如不能立即用于抽提DNA,可置于4℃保存,但不要超过2个月,欲长期储存,分装-20℃储存。
2
DB22/T1673—2012
25mg~30mg动物组织(新鲜或冷冻组织均可),放入1.5mL离心管中,加入500μLTE缓冲液,用
匀浆仪研碎。匀浆液10000r/min,离心2min,弃上清,沉淀备用。
8检测程序
8.1样品DNA提取
在上述样品沉淀中加入560μLTE缓冲液,反复吹打使之重悬,加入30μL的10%SDS和3μL蛋白酶K
(20mg/mL),混匀,37℃孵育1h;加入100μL5mol/LNaCl,充分混匀,再加入80μLCTAB/NaCl
溶液,混匀,65℃温育10min;加入等体积的氯仿/异戊醇,混匀,12000r/min离心5min,将上清
转入一新离心管中;加入0.6倍体积异丙醇,轻轻混合直到DNA沉淀下来,10000r/min离心15min,去
上清;7
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