烟碱转运候选基因NtABCG6L生物信息学及表达特征分析.pdfVIP

山东农业科学２０２４ꎬ５６(４):２０~２７ꎬ４５ＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ

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ＤＯＩ:１０.１４０８３/ｊ.ｉｓｓｎ.１００１４９４２.２０２４.０４.００３

烟碱转运候选基因ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ生物信息学

及表达特征分析

１ꎬ２２１ꎬ２１ꎬ２２１ꎬ２１ꎬ２

龙本山ꎬ莫泽君ꎬ张静瑶ꎬ彭丽沙ꎬ段丽丽ꎬ罗家骏ꎬ刘仁祥

(１.贵州大学烟草学院ꎬ贵州贵阳５５００２５ꎻ２.贵州省烟草品质研究重点实验室ꎬ贵州贵阳５５００２５)

摘要:为预测前期筛选到的可能影响烟草烟碱含量的ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因是否具有转运烟碱功能ꎬ本研究采

用生物信息学方法对ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因的启动子序列以及编码蛋白的理化性质和结构进行分析ꎬ利用软件对烟

碱与ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ蛋白进行分子对接ꎬ并分别在烟株打顶０、７、１４、２１ｄ取根、茎、叶测定烟碱含量和ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ

基因的相对表达量ꎬ以分析ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因表达量与烟碱转运效率的关系ꎮ结果表明ꎬＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因共编码

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７２９个氨基酸ꎻＮｔＡＢＣＧ６Ｌ蛋白分子量为８１.２９ｋＤａꎬ理论ｐＩ值为８.９７ꎬ含有ＡＢＣ＿ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｌｉｋｅ＿ＡＴＰｂｄ、ＡＢ￣

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ＣＧ＿ｄｏｍ、ＡＢＣ＿２＿ｔｒａｎｓ结构域ꎬ二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成ꎬ存在跨膜结构ꎬ主要定位在细胞膜

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上ꎬ预测ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ是一个跨膜转运蛋白ꎮＮｔＡＢＣＧ６Ｌ蛋白与烟碱可以通过氢键结合ꎬ结合能为２.９５ꎮＮｔ￣

ＡＢＣＧ６Ｌ基因主要在烟草根部表达ꎬ打顶１４ｄ表达量最高ꎬ其表达量与烟碱转运系数呈显著正相关关系ꎬ初

步推测ＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因参与了烟碱的转运过程ꎮ本研究结果可为进一步采用基因编辑技术明确其功能提供

依据ꎮ

关键词:烟草ꎻＮｔＡＢＣＧ６Ｌ基因ꎻ生物信息学分析ꎻ烟碱转运ꎻ基因表达

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中图分类号:Ｓ５７２:Ｑ７８６文献标识号:Ａ文章编号:１００１４９４２(２０２４)０４００２００９

ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎｄＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎＣｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＮｉｃｏｔｉｎｅ

ＴｒａｎｓｐｏｒｔＣａｎｄｉｄａｔｅＧｅｎｅＮｔＡＢＣＧ６Ｌ

１ꎬ２２１ꎬ２１ꎬ２２１ꎬ２１ꎬ２

ＬｏｎｇＢｅｎｓｈａｎꎬＭｏＺｅｊｕｎꎬＺｈａｎｇＪｉｎｇｙａｏꎬＰｅｎｇＬｉｓｈａꎬＤｕａｎＬｉｌｉꎬＬｕｏＪｉａｊｕｎꎬＬｉｕＲｅｎｘｉａｎｇ

(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＴｏｂａｃｃｏꎬＧｕｉｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＧｕｉｙａｎｇ５５００２５ꎬＣｈｉｎａꎻ

２.ＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＴｏｂａｃｃｏＱｕａｌｉｔｙＲｅｓｅａｒｃｈｉｎＧｕｉｚｈｏｕＰｒｏｖｉｎｃｅꎬＧｕｉｙａｎｇ５５００２５ꎬ