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分子植物育种，2021年，第19卷，第9期，第2985-2992页

MolecularPlantBreeding,2021,Vol.19,No.9,2985-2992

研宄报告

ResearchReport

星油藤转录组SSR序列特征分析及其分子标记开发

朱阅u郭亚静2冯程2潘帮珍2何惠英2徐增富2杜光辉1•付乾堂〃

I云南大学农学院，昆明，650500:2中国科学院西双版纳热带植物园，种子创新研究院，中国科学院热带植物资源可持续利用重点实验室，勐

腊，666303

*共同通信作者,du0425@163.com;ftiqiantang@xtbg.ac.c

摘要基于星油藤(P/uA:enetiatioZuhZbL.)转录组丨g息，分析其表达序列标签-间单序列重复(expressed

sequencetag-simplesequencerepeat,EST-SSR)并设计引物进行验证，为星油藤的SSR分子标记开发提供数

据支持。本研究利用MISA软件对星油藤雌雄花序芽转录组测序所获得的57664条Unigenes进行分析，

共检测出10572个SSR位点；其中8825条Unigenes分布有SSR位点，占总Unigenes的15.30%。SSR位

点的平均分布频率为每5.34kb出现1个SSR位点。各类型的SSR位点共有154种，其中单核苷酸重复

(40.48%)、二核苷酸重复(25.82%)和三核苷酸重复(28.89%)为主要的重复类型，A/T、AG/TC和AAG/CTT分

别为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸类型中主导的重复基序。利用Primer3.0设计EST-SSR引物，并随机挑

选75对SSR引物，以星油藤及其2个近缘种(亚洲星油藤和大果星油藤)为材料进行筛选验证，其中31对引

物可进行有效扩增，并最终获得7对在3个物种间具有多态性的引物。本研宄结果表明，星油藤转录组测序

产生的Unigenes序列信息作为开发SSR分子标记是可行的，开发的这些SSR分子标记可用于星油藤及其

近缘种的遗传多样性评价、种质资源鉴定和分了标记辅助育种等研宂。

关键词星油藤；亚洲星油藤；大果星油藤;转录组;EST-SSR

CharacteristicAnalysisofSSRSequencesandDevelopmentofMolecular

MarkersBasedonPlukenetiavolubilisTranscriptome

ZhuYueuGuoYajing2FengCheng2PanBangzhen2HeHuiying2XuZengfu2DuGuanghui*Fu

Qiantang2*

1CollegeofAgriculture,YuanUniversity,Kunming,650500;2CASKeyLaboratoryofTropicalPlantResourcesandSustainableUse,Iovative

AcademyofSeedDesign,XishuangbaaTropicalBotanicalGarden,ChineseAcademyofSciences,Mengla,666303

*Co-correspondingauthors,du0425@163.com;fliqiantang@xtbg.ac.c

DOI:10.13271/j.mpb.019.002985

AbstractInordertodevelopsimplesequencerepeat(SSR)molecularmarkersinPlukenetiavolubilis,theexpre­

ssedsequencetag-SSR(EST-SSR)lociinformationwasanalyzedbasedonthetranscriptomeofthisplant,and

specificprimersofSSRsweredesignedtoconfirmtheirvalidity.Atotalof10572S