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中国农业科技导报,2024,26(9):44-53

JournalofAgriculturalScienceandTechnology

猪CREBRF基因生物信息学和表达规律分析

1,23242*

郭肖蓉,刘颖,樊佳珍,黄涛,周荣

(1.佛山大学生命科学与工程学院,广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山528225;2.中国农

业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;3.内蒙古科技大学生命科学与技术学院,内蒙古包头014010;

4.石河子大学动物科技学院,新疆石河子832000)

摘要:CREBRF基因在雌性动物生殖过程中具有重要调控作用,为了深入了解猪的CREBRF基因特征和功

能,对CREBRF基因进行生物信息学分析,并通过RT-qPCR分析不同阶段巴马猪卵巢组织中CREBRF的表达

规律。结果显示,在5个品种猪基因组上鉴定到20个CREBRF基因的碱基突变,其中7个为同义突变,13个为

错义突变。猪CREBRF基因的CDS区全长1920bp,共编码639个氨基酸,不稳定系数较高,为亲水性蛋白,有

6

85个高置信度的磷酸化位点和4个糖基化位点,且CREBRF的mRNA具有20个高可信度的mA甲基化修饰位

点,猪、人和小鼠中的CREBRF蛋白保守性较强。RT-qPCR结果显示,猪卵巢中CREBRF基因的表达量在猪出

生0和28d时表达水平较高,随着猪生长发育,在出生180d时表达量显著降低,在母猪妊娠38和80d时

CREBRF的表达再次升高。通过比对不同品种猪中CREBRF基因CDS区的碱基突变并分析该基因的理化性

质及表达规律,发现了CREBRF基因在猪胎儿期、出生早期和妊娠期卵巢组织中的高表达,推测CREBRF在母

猪生殖过程中起重要作用,为猪高繁殖力基因挖掘和分子标记开发提供参考。

关键词:猪;卵巢;CREBRF;生物信息学分析;基因表达

doi:10.13304/j.nykjdb.2024.0154

中图分类号:S828文献标志码:A文章编号:1008­0864(2024)09­0044­10

BioinformaticsAnalysisofPorcineCREBRFGeneand

ItsExpressionPattern

1,23242*

GUOXiaorong,LIUYing,FANJiazhen,HUANGTao,ZHOURong

(1.GuangdongProvincialKeyLaboratoryofAnimalMolecularDesignandPreciseBreeding,SchoolofLifeScienceand

Engineering,FoshanUniversity,GuangdongFoshan528231,China;2.InstituteofAnimalScience,ChineseAcademyof

AgriculturalSciences,Beijing100193

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