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中国农业科技导报,2024,26(9):44-53
JournalofAgriculturalScienceandTechnology
猪CREBRF基因生物信息学和表达规律分析
1,23242*
郭肖蓉,刘颖,樊佳珍,黄涛,周荣
(1.佛山大学生命科学与工程学院,广东省动物分子设计与精准育种重点实验室,广东佛山528225;2.中国农
业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193;3.内蒙古科技大学生命科学与技术学院,内蒙古包头014010;
4.石河子大学动物科技学院,新疆石河子832000)
摘要:CREBRF基因在雌性动物生殖过程中具有重要调控作用,为了深入了解猪的CREBRF基因特征和功
能,对CREBRF基因进行生物信息学分析,并通过RT-qPCR分析不同阶段巴马猪卵巢组织中CREBRF的表达
规律。结果显示,在5个品种猪基因组上鉴定到20个CREBRF基因的碱基突变,其中7个为同义突变,13个为
错义突变。猪CREBRF基因的CDS区全长1920bp,共编码639个氨基酸,不稳定系数较高,为亲水性蛋白,有
6
85个高置信度的磷酸化位点和4个糖基化位点,且CREBRF的mRNA具有20个高可信度的mA甲基化修饰位
点,猪、人和小鼠中的CREBRF蛋白保守性较强。RT-qPCR结果显示,猪卵巢中CREBRF基因的表达量在猪出
生0和28d时表达水平较高,随着猪生长发育,在出生180d时表达量显著降低,在母猪妊娠38和80d时
CREBRF的表达再次升高。通过比对不同品种猪中CREBRF基因CDS区的碱基突变并分析该基因的理化性
质及表达规律,发现了CREBRF基因在猪胎儿期、出生早期和妊娠期卵巢组织中的高表达,推测CREBRF在母
猪生殖过程中起重要作用,为猪高繁殖力基因挖掘和分子标记开发提供参考。
关键词:猪;卵巢;CREBRF;生物信息学分析;基因表达
doi:10.13304/j.nykjdb.2024.0154
中图分类号:S828文献标志码:A文章编号:10080864(2024)09004410
BioinformaticsAnalysisofPorcineCREBRFGeneand
ItsExpressionPattern
1,23242*
GUOXiaorong,LIUYing,FANJiazhen,HUANGTao,ZHOURong
(1.GuangdongProvincialKeyLaboratoryofAnimalMolecularDesignandPreciseBreeding,SchoolofLifeScienceand
Engineering,FoshanUniversity,GuangdongFoshan528231,China;2.InstituteofAnimalScience,ChineseAcademyof
AgriculturalSciences,Beijing100193
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