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第51卷第2期吉林大学学报(医学版)Vol.51No.2

3782025年3月JournalofJilinUniversity(MedicineEdition)Mar.2025

[文章编号]1671‐587X(2025)02‐0378‐14DOI::10.13481/j.1671‐587X.

蛋白激酶D2在膀胱癌组织中的表达及其对肿瘤免疫

微环境的影响

1,21,31,3333311,3

蔡文畅,刘雨齐,王涵,王鹤霖,王振江,肖梓屾,马士远,安丽萍,刘艳波

(1.北华大学长白山药用动植物活性多肽研究与开发国家地方联合工程实验室,吉林吉林132013;

2.北华大学校医院检验科,吉林吉林132013;3.北华大学基础医学院病理生理学教研室,

吉林吉林132013)

[[摘要]]目的目的::利用生物信息学技术探讨蛋白激酶D2(PRKD2)在膀胱癌(BLCA)组织中的表

达及其表达对BLCA患者预后的影响,阐明PRKD2在BLCA发生发展中的作用。方法方法::从UCSC癌

症基因组数据库下载9例正常膀胱样本、19例BLCA癌旁样本和407例BLCA肿瘤样本的数据。采用

Mann-WhitneyU检验分析PRKD2mRNA在BLCA肿瘤组织与正常膀胱组织中的表达差异,并利用人

类蛋白数据库(HPA)进行蛋白组学的验证。使用R软件的DESeq2包对PRKD2低表达组和PRKD2

高表达组BLCA样本进行差异表达基因(DEGs)筛选及鉴定,使用ggplot2包绘制PRKD2的共表达

热图,利用基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对DEGs进行GO功能

注释及KEGG信号通路富集分析,并使用基因富集分析(GSEA)获得DEGs明显富集的基因集。根

据PRKD2的表达水平将BLCA样本分为低表达组和高表达组,使用GSVA包分析BLCA患者PRKD2

表达与免疫细胞浸润之间相关性。使用survival包和survminer包进一步分析PRKD2与BLCA患者预

后的关系。使用cBioPortal数据库对BLCA组织的PRKD2基因突变情况进行分析。收集膀胱炎、膀胱

息肉和BLCA组织,使用免疫组织化学染色技术检测BLCA及对照组织中白细胞介素17F(IL-17F)

蛋白表达水平。结果结果::PRKD2在多种恶性肿瘤组织中高表达,BLCA组织中PRKD2mRNA和蛋白表

达水平较正常膀胱组织明显升高(P0.05)。对PRKD2单基因差异分析共得到1058个DEGs,其中

上调DEGs29个,下调DEGs1029个。GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,DEGs主要富集于

涉及感官知觉的化学刺激、卡哈尔体和内肽酶抑制剂活性等生物学过程(BP)以及金黄色葡萄球菌

感染通路和年轻人的成熟型糖尿病通路。GSEA分析,DEGs主要富集于Notch信号通路、维甲酸诱

导基因I

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