- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
第51卷第2期吉林大学学报(医学版)Vol.51No.2
3782025年3月JournalofJilinUniversity(MedicineEdition)Mar.2025
[文章编号]1671‐587X(2025)02‐0378‐14DOI::10.13481/j.1671‐587X.
蛋白激酶D2在膀胱癌组织中的表达及其对肿瘤免疫
微环境的影响
1,21,31,3333311,3
蔡文畅,刘雨齐,王涵,王鹤霖,王振江,肖梓屾,马士远,安丽萍,刘艳波
(1.北华大学长白山药用动植物活性多肽研究与开发国家地方联合工程实验室,吉林吉林132013;
2.北华大学校医院检验科,吉林吉林132013;3.北华大学基础医学院病理生理学教研室,
吉林吉林132013)
[[摘要]]目的目的::利用生物信息学技术探讨蛋白激酶D2(PRKD2)在膀胱癌(BLCA)组织中的表
达及其表达对BLCA患者预后的影响,阐明PRKD2在BLCA发生发展中的作用。方法方法::从UCSC癌
症基因组数据库下载9例正常膀胱样本、19例BLCA癌旁样本和407例BLCA肿瘤样本的数据。采用
Mann-WhitneyU检验分析PRKD2mRNA在BLCA肿瘤组织与正常膀胱组织中的表达差异,并利用人
类蛋白数据库(HPA)进行蛋白组学的验证。使用R软件的DESeq2包对PRKD2低表达组和PRKD2
高表达组BLCA样本进行差异表达基因(DEGs)筛选及鉴定,使用ggplot2包绘制PRKD2的共表达
热图,利用基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对DEGs进行GO功能
注释及KEGG信号通路富集分析,并使用基因富集分析(GSEA)获得DEGs明显富集的基因集。根
据PRKD2的表达水平将BLCA样本分为低表达组和高表达组,使用GSVA包分析BLCA患者PRKD2
表达与免疫细胞浸润之间相关性。使用survival包和survminer包进一步分析PRKD2与BLCA患者预
后的关系。使用cBioPortal数据库对BLCA组织的PRKD2基因突变情况进行分析。收集膀胱炎、膀胱
息肉和BLCA组织,使用免疫组织化学染色技术检测BLCA及对照组织中白细胞介素17F(IL-17F)
蛋白表达水平。结果结果::PRKD2在多种恶性肿瘤组织中高表达,BLCA组织中PRKD2mRNA和蛋白表
达水平较正常膀胱组织明显升高(P0.05)。对PRKD2单基因差异分析共得到1058个DEGs,其中
上调DEGs29个,下调DEGs1029个。GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,DEGs主要富集于
涉及感官知觉的化学刺激、卡哈尔体和内肽酶抑制剂活性等生物学过程(BP)以及金黄色葡萄球菌
感染通路和年轻人的成熟型糖尿病通路。GSEA分析,DEGs主要富集于Notch信号通路、维甲酸诱
导基因I
您可能关注的文档
- 大功率发动机轴瓦失效分析及预防措施.pdf
- 七星渠灌区信息化改造及效果分析.pdf
- 意大利蜜蜂DnaJC28的生物信息学分析.pdf
- 玉米ZmMAPKKK21基因的克隆和生物信息学分析.pdf
- ORC发电机组不锈钢换热管裂漏失效机制分析及预防.pdf
- 白桦BpHsfA4a基因克隆及生物信息学分析.pdf
- 水稻PEPCK基因家族的生物信息学和表达分析.pdf
- 如何发展公平且有质量的教育——基于芬兰学习权方案的分析与启示.pdf
- 近10年国外远程办公研究进展与本土化启示——基于CiteSpace的可视化分析.pdf
- IL-6借助细胞焦亡刺激主动脉夹层的进展:一项基于已有数据库的差异性分析.pdf
- 牦牛DJ-1基因克隆、生物信息学及组织表达分析.pdf
- 大豆GmEXPB3和GmEXPB6生物信息学分析及干旱和盐胁迫诱导表达.pdf
- 踝关节运动预防骨科术后深静脉血栓形成的meta分析.pdf
- 合作猪SIRT 3基因克隆、生物信息学分析及组织表达研究.pdf
- 虾肝肠胞虫Septin的生物信息学分析及其在增殖中的潜在作用.pdf
- 北方早粳南引早稻种植的适应性分析及育种启示.pdf
- 少构造体系,多研究问题:分析美学的启示.pdf
- 美国《编目和元数据专业馆员核心能力》2023年版修订内容分析与启示.pdf
- 玉米ZmAOS基因家族的鉴定及生物信息学分析.pdf
- 来特莫韦用于异基因造血干细胞移植后巨细胞病毒感染和巨细胞病毒病预防的成本-效用分析.pdf
人力资源管理师持证人
专注于各类文档、文案、文稿的写作、修改、润色和各领域PPT文档的制作,收集有海量各类规范类文件。欢迎咨询!
文档评论(0)