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南方农业学报JournalofSouthernAgriculture2025,56(1):135-148
ISSN2095-1191;CODENNNXAAB
DOI:10.3969/j.issn.2095-1191.2025.01.012
构树bZIP基因家族鉴定及硒代谢相关基因筛选
1111211*1*
卜宪辰,郭龙飞,祝嫦晔,陈强文,程水源,张威威,许锋,廖咏玲
12
(长江大学园艺园林学院,湖北荆州434025;武汉轻工大学国家富硒农产品加工技术研发专业中心,湖北武汉430023)
摘要:【目的】对构树bZIP基因家族成员进行鉴定及分析,并筛选构树中参与硒代谢的关键基因,为深入研究构树
bZIP基因家族生物学功能及其在构树硒代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】基于构树全基因组数据,利用生物
信息学方法鉴定构树bZIP基因家族成员,并对其基因结构、启动子顺式作用元件、蛋白的系统进化关系等进行分析,
并通过根癌农杆菌介导烟草叶片的瞬时转化法进行蛋白亚细胞定位。通过转录组测序(RNA-Seq)和实时荧光定量
PCR分析构树bZIP家族基因在不同硒源及不同浓度处理下的表达水平。【结果】共鉴定得到38个bZIP基因家族成员
(BpbZIP01~BpbZIP38),编码的氨基酸数量为140~894个,相对分子质量为16357.39~96969.63Da,理论等电点为
5.24~9.76,均为亲水性蛋白,不稳定系数为52.54~73.89,36个BpbZIPs蛋白定位于细胞核,BpbZIP15和BpbZIP19分别
定位于过氧化物酶体和内质网。由系统发育进化树可知,将BpbZIPs蛋白分为10个亚族,BpbZIPs蛋白在各亚族中
的数量为6个(A亚族)、1个(B亚族)、1个(C亚族)、7个(D亚族)、2个(E亚族)、1个(F亚族)、4个(G亚族)、2个(H亚族)、
6个(I亚族)和8个(S亚族),各亚族中多数BpbZiPs与桑树bZIP聚成一支。不同BpbZIPs基因在外显子数量上差异较
大,为1~16个,但相同亚族的基因长度和结构具有一定的相似性。BpbZIPs基因启动子含有光响应、激素和胁迫应答
等多种响应元件。在不同浓度的硒酸钠和亚硒酸钠处理下,除BpbZIP17基因未表达外,其余BpbZIPs基因均对硒处
理有上调或下调表达。结合相关分析和实时荧光定量PCR结果可知,亚硒酸钠和硒酸钠处理后BpbZIP04和
BpbZIP05基因的表达水平均与总硒含量密切相关。【结论】构树bZIP基因家族成员参与多种生物和非生物胁迫,
BpbZIP04和BpbZIP05基因在构树硒代谢与耐受性中发挥重要作用。
关键词:构树;bZIP基因家族;生物信息学分析;表达模式;硒代谢
中图分类号:S792.99文献标志码:A文章编号:2095-1191(2025)01-0135-14
IdentificationofbZIPgenefamilyandscreeningofselenium
metabolism-relatedcandidategenesinBroussonetia
papyriferaL.
1111
BUXian-chen,GUOLong-fei,ZHUChang-ye,CHENQiang-wen,
CHENGShui-yuan21
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